More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56634 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05528  ABC transporter (Eurofung)  64.73 
 
 		 721 aa  803    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649835  normal  0.920621 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56634  mitochondrial ABC transporter  100 
 
 		 622 aa  1273    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.718195 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01920  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  61.5 
 
 		 734 aa  758    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  47.63 
 
 		 646 aa  567  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.91 
 
 		 628 aa  560  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1701  ABC transporter related  48.55 
 
 		 598 aa  559  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0449  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.32 
 
 		 625 aa  561  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  47.34 
 
 		 610 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  48.7 
 
 		 591 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  48.53 
 
 		 590 aa  556  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  48.01 
 
 		 607 aa  556  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  46.17 
 
 		 652 aa  555  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  47.49 
 
 		 661 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  46.08 
 
 		 612 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  46.25 
 
 		 612 aa  551  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  45.54 
 
 		 651 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  49.3 
 
 		 606 aa  545  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.21 
 
 		 628 aa  547  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0555  ABC transporter related  45.19 
 
 		 628 aa  548  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0630  ABC transporter related  48.03 
 
 		 597 aa  547  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  46.97 
 
 		 607 aa  545  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0482  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.86 
 
 		 627 aa  542  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0853  ABC transporter-related protein  47.32 
 
 		 591 aa  545  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  48.1 
 
 		 590 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  47.02 
 
 		 593 aa  544  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  47.68 
 
 		 598 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3504  multidrug ABC transporter ATPase/permease  45.61 
 
 		 657 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  45.47 
 
 		 655 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1175  ABC transporter related  45.1 
 
 		 625 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  47.68 
 
 		 594 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  47.51 
 
 		 596 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1023  ABC transporter related  44.93 
 
 		 625 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.037611  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2616  ABC transporter ATP-binding protein  48.43 
 
 		 591 aa  538  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.603716 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 596 aa  535  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0823  ABC transporter related  45.48 
 
 		 625 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  42.7 
 
 		 647 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13171  ABC(ABCB) family transporter: mitochondrial ATM1-like protein (ABCB)  44.66 
 
 		 645 aa  533  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.110905  hitchhiker  0.00036774 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  45.74 
 
 		 603 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  47.27 
 
 		 597 aa  532  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  44.35 
 
 		 640 aa  531  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  44.55 
 
 		 592 aa  531  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0585  ABC transporter related  46.85 
 
 		 623 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  46.68 
 
 		 629 aa  531  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  44.92 
 
 		 672 aa  531  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1492  ABC transporter related  45.03 
 
 		 652 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  46.15 
 
 		 612 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  45.41 
 
 		 626 aa  531  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0439  putative composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  45.41 
 
 		 621 aa  529  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3236  ABC transporter related  46.8 
 
 		 598 aa  530  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00224105  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  46.51 
 
 		 631 aa  525  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.52 
 
 		 651 aa  525  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1349  ABC transporter related  45.58 
 
 		 608 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2074  ABC transporter related  45.47 
 
 		 651 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  46.15 
 
 		 612 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  45.83 
 
 		 606 aa  528  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4079  ABC transporter-related protein  47.64 
 
 		 590 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0722  ABC transporter related  45.68 
 
 		 627 aa  524  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0581  ABC transporter related  44.56 
 
 		 603 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  46.51 
 
 		 596 aa  525  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  45.92 
 
 		 606 aa  522  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  46.51 
 
 		 596 aa  525  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  45.83 
 
 		 630 aa  522  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02200  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 577 aa  524  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  42.31 
 
 		 672 aa  523  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  46.35 
 
 		 623 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0204  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.35 
 
 		 623 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  42.62 
 
 		 655 aa  519  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  46.35 
 
 		 623 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3826  ABC transporter related  46.8 
 
 		 598 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.094291  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  46.35 
 
 		 623 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3644  ABC transporter related  46.8 
 
 		 598 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00219538  normal  0.175783 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2740  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  46.35 
 
 		 623 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  46.35 
 
 		 654 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  43.38 
 
 		 644 aa  519  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3702  ABC transporter related  46.63 
 
 		 598 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0803  ABC transporter related  46.8 
 
 		 598 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000452129  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  47.13 
 
 		 595 aa  520  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  46.51 
 
 		 623 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  46.34 
 
 		 623 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  45.2 
 
 		 607 aa  519  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  46.34 
 
 		 623 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  46.69 
 
 		 589 aa  521  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2338  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.35 
 
 		 623 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.587388  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2980  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.1 
 
 		 602 aa  517  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53006  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  44.54 
 
 		 622 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1765  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  44.37 
 
 		 611 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.193785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  44.99 
 
 		 617 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0602  ABC transporter related  44.39 
 
 		 603 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19150  ABC transporter, composite transmembrane permease and ATP binding components  46.85 
 
 		 615 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3460  ABC transporter related  45.92 
 
 		 621 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0393  ABC transporter related  45.83 
 
 		 631 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0348  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  44.43 
 
 		 605 aa  514  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0672  ABC transporter related  45.58 
 
 		 629 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.798433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6041  ABC transporter, fused ATPase and innermembrane subunits  44.99 
 
 		 623 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  44.73 
 
 		 608 aa  512  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2899  ABC transporter related  46.27 
 
 		 601 aa  514  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0186152  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  46 
 
 		 623 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  42.11 
 
 		 662 aa  510  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2194  ABC transporter related  45.01 
 
 		 624 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3906  ABC transporter related  44.93 
 
 		 619 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.366472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>