More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl118 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl118  multidrug ABC transporter  100 
 
 
529 aa  1040    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.62 
 
 
524 aa  166  8e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  25.97 
 
 
541 aa  154  5e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl168  unknown substrate ABC transporter permease component  26.11 
 
 
530 aa  146  9e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  25.9 
 
 
577 aa  146  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  29.15 
 
 
572 aa  144  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  28.35 
 
 
546 aa  136  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3382  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  26.31 
 
 
574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000301106 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1776  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.27 
 
 
533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000237655  hitchhiker  0.000000219976 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1829  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.87 
 
 
525 aa  134  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000147985  normal  0.205804 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1763  transport ATP-binding protein  26.01 
 
 
574 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162494  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0956  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.27 
 
 
535 aa  130  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000165246  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1946  transport ATP-binding protein CydD  25.27 
 
 
574 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0563  cytochrome bd biosynthesis ABC-type transporter, ATPase and permease component  24.77 
 
 
574 aa  129  9.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0681013  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  24.67 
 
 
526 aa  128  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1981  transport ATP-binding protein CydD  25.82 
 
 
574 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.47079e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1806  transport ATP-binding protein CydD  25.46 
 
 
574 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1946  transport ATP-binding protein CydD  25.46 
 
 
574 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2125  lipid ABC transporter, ATP-binding/permease protein MsbA  25.14 
 
 
602 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153506  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1058  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25 
 
 
525 aa  125  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000167907  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0552  ABC transporter, ATP-binding protein  24.08 
 
 
588 aa  124  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126297 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.51 
 
 
555 aa  124  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  26.05 
 
 
613 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1038  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.72 
 
 
526 aa  124  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000482306  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.66 
 
 
528 aa  124  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000153215  normal  0.145022 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  36.79 
 
 
579 aa  123  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0316  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.13 
 
 
529 aa  122  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000154446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  22.52 
 
 
594 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1780  transport ATP-binding protein  25.46 
 
 
574 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0340  ABC transporter related  25.42 
 
 
580 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2024  transport ATP-binding protein CydD  25.41 
 
 
574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.605538  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2045  transport ATP-binding protein CydD  24.91 
 
 
574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  21.86 
 
 
632 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.51 
 
 
573 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.48 
 
 
587 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1055  ABC transporter related  25.82 
 
 
554 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  36.32 
 
 
590 aa  120  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0894  ABC transporter related  26.53 
 
 
535 aa  120  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0188  ABC transporter related  25.42 
 
 
611 aa  119  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.55078  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  33.94 
 
 
591 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  25.82 
 
 
608 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1056  ABC transporter related  23.26 
 
 
546 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000469517  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2054  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.76 
 
 
593 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2757  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  22.08 
 
 
573 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000336134  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2303  ABC transporter related protein  26.46 
 
 
552 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.347808  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  34.3 
 
 
596 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  21.57 
 
 
622 aa  119  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1718  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  26.47 
 
 
563 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.066866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  24.35 
 
 
597 aa  117  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  25.76 
 
 
612 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  25.76 
 
 
612 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1721  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  23.23 
 
 
993 aa  117  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.489544 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.8 
 
 
586 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  34.3 
 
 
594 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.5 
 
 
582 aa  117  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  34.3 
 
 
598 aa  117  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.86 
 
 
582 aa  117  6.9999999999999995e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.2758  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  24.35 
 
 
597 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  20.82 
 
 
606 aa  116  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  23.19 
 
 
583 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  24.7 
 
 
590 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1979  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  22.78 
 
 
589 aa  116  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0415  cytochrome bd biosynthesis ABC-type transporter, ATPase and permease component  26.89 
 
 
570 aa  116  8.999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.762356  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  25.67 
 
 
596 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2443  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  21.9 
 
 
573 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0221682  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  23.36 
 
 
764 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  24.25 
 
 
584 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.75 
 
 
597 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0959  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  21.9 
 
 
573 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0508  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  23.05 
 
 
581 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00890  fused cysteine transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  21.9 
 
 
573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.140695  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  22.85 
 
 
608 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.4 
 
 
574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00897  hypothetical protein  21.9 
 
 
573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2710  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  21.9 
 
 
573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00743956  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.4 
 
 
574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0990  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  21.9 
 
 
573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.034293  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  31.47 
 
 
720 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  24.49 
 
 
646 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0273  ABC transporter related  23.02 
 
 
566 aa  115  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7197  ABC transporter related  24.19 
 
 
584 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  26.09 
 
 
593 aa  115  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.65 
 
 
582 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2235  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  21.72 
 
 
573 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.228638  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  23.3 
 
 
971 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  32.2 
 
 
612 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  26.43 
 
 
598 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.61 
 
 
586 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1410  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  30.88 
 
 
573 aa  114  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215982  normal  0.551015 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  34.07 
 
 
623 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.57 
 
 
582 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.45 
 
 
582 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1770  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.37 
 
 
607 aa  114  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0549134  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  32.2 
 
 
612 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  33.77 
 
 
643 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1048  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  21.9 
 
 
573 aa  114  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00703817  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  34.01 
 
 
706 aa  114  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3644  ABC transporter related  34.33 
 
 
598 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00219538  normal  0.175783 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  24.6 
 
 
584 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1453  ABC transporter related  34.56 
 
 
571 aa  114  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>