More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0894 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0894  ABC transporter related  100 
 
 
535 aa  1052    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  28.05 
 
 
718 aa  157  6e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  24.79 
 
 
597 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  24.79 
 
 
597 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  26.18 
 
 
582 aa  144  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.48 
 
 
566 aa  143  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0895  ABC transporter related  26.19 
 
 
534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  28.48 
 
 
566 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  24.31 
 
 
550 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1453  ABC transporter related  25.53 
 
 
571 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  26.62 
 
 
575 aa  140  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  22.36 
 
 
575 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  26.02 
 
 
592 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  24.34 
 
 
613 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1507  ABC transporter related  27.25 
 
 
572 aa  138  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.112704  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1466  ABC transporter related  27.25 
 
 
572 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1498  ABC transporter related  25.98 
 
 
571 aa  139  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  27.21 
 
 
574 aa  139  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  22.6 
 
 
600 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  24.16 
 
 
617 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  25.95 
 
 
585 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.85 
 
 
587 aa  134  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  24.59 
 
 
586 aa  134  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2358  ABC transporter related  24.53 
 
 
619 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1506  ABC transporter related  27.23 
 
 
564 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00391095  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1465  ABC transporter related  27.23 
 
 
564 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  23.66 
 
 
585 aa  134  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  21.17 
 
 
601 aa  133  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  26.42 
 
 
712 aa  133  6.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  25.23 
 
 
468 aa  133  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0385  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.06 
 
 
572 aa  133  7.999999999999999e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0640638  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02020  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  22.2 
 
 
676 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.428609  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.15 
 
 
600 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0384  multidrug ABC transporter  25 
 
 
578 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  22.4 
 
 
598 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  24.06 
 
 
602 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  22.87 
 
 
556 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  25.61 
 
 
581 aa  133  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  21.85 
 
 
613 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10431  ABC transporter  24.22 
 
 
548 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  22.34 
 
 
581 aa  132  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  25.53 
 
 
734 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  25.43 
 
 
582 aa  132  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  26.42 
 
 
712 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  25 
 
 
578 aa  131  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  21.82 
 
 
583 aa  131  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  23.22 
 
 
589 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  26.65 
 
 
606 aa  131  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.45 
 
 
586 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  24.46 
 
 
618 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  21.53 
 
 
639 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2169  ABC transporter related  23.78 
 
 
620 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  24.57 
 
 
588 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  21.49 
 
 
578 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0417  ABC transporter related  25.41 
 
 
597 aa  130  6e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  24.26 
 
 
624 aa  130  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1274  ABC transporter related protein  24.96 
 
 
572 aa  130  7.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  25.19 
 
 
578 aa  130  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  25.19 
 
 
578 aa  130  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7197  ABC transporter related  23.72 
 
 
584 aa  130  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  27.31 
 
 
579 aa  130  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.23 
 
 
586 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  28.06 
 
 
598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0688  ABC transporter related  27.45 
 
 
559 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.45 
 
 
586 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0410  putative ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.53 
 
 
557 aa  129  1.0000000000000001e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  21.14 
 
 
582 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  24.79 
 
 
597 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  22.98 
 
 
600 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  23.81 
 
 
583 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1304  ABC transporter related  25.78 
 
 
602 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.3 
 
 
596 aa  129  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  23.11 
 
 
586 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  20.84 
 
 
641 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0637  ABC transporter related  22.36 
 
 
588 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  24.6 
 
 
599 aa  129  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13891  ABC transporter  22.5 
 
 
592 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.23 
 
 
586 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  23.23 
 
 
586 aa  128  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  23.23 
 
 
586 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  23.8 
 
 
577 aa  128  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.5 
 
 
586 aa  128  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  26.32 
 
 
596 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  23.23 
 
 
586 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  23.23 
 
 
586 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  26.61 
 
 
737 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  24.63 
 
 
705 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2802  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  21.37 
 
 
601 aa  127  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  24.5 
 
 
615 aa  127  5e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  20.39 
 
 
552 aa  127  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  24.71 
 
 
575 aa  127  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  23.26 
 
 
584 aa  127  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4514  ABC transporter related  21.93 
 
 
600 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.350646  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  26.89 
 
 
738 aa  127  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.59 
 
 
601 aa  126  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0471  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.38 
 
 
593 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344277  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  21.33 
 
 
582 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  22.32 
 
 
596 aa  126  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10431  ABC transporter  23.04 
 
 
547 aa  126  9e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503648  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1371  ABC transporter-related protein  22.61 
 
 
613 aa  126  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>