More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0060 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0060  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  465  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.235651  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1095  Sigma 54 interacting domain protein  55.6 
 
 		 232 aa  258  5.0000000000000005e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.96 
 
 		 218 aa  175  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  41.23 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  41.63 
 
 		 249 aa  172  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0403  ABC transporter related  44.72 
 
 		 217 aa  172  5.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.784809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  43.29 
 
 		 229 aa  171  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  42.29 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  41.35 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  41.2 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  42.11 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  41.23 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  43.88 
 
 		 200 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  46.5 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  45.87 
 
 		 265 aa  168  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  41.33 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 233 aa  167  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  39.41 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  41.51 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  45.45 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  43 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  46 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  47.55 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0699  ABC transporter related  45.77 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.664628  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  43.94 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  45.05 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  43.63 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  42.36 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  40.39 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  47.2 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  44.5 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  42.21 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  39.04 
 
 		 246 aa  165  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  44.22 
 
 		 237 aa  166  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0412  ATPase  43.3 
 
 		 249 aa  165  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 262 aa  165  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  40.89 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  42.57 
 
 		 242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  45 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  45.71 
 
 		 233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  42.57 
 
 		 250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3253  ABC transporter-related protein  47.39 
 
 		 230 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  46.04 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.9 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  45.83 
 
 		 233 aa  165  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  43.07 
 
 		 232 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  41.63 
 
 		 249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  40.36 
 
 		 291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  48.06 
 
 		 235 aa  164  8e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  41.63 
 
 		 249 aa  164  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  41.63 
 
 		 249 aa  164  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  45.19 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1654  ABC transporter related  45.37 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.185318 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  45.27 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  42.5 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  42.8 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1694  peptide ABC transporter ATPase  39.91 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000011753  unclonable  4.03836e-28 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  37.85 
 
 		 232 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 255 aa  162  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  45.77 
 
 		 234 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  44.34 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  39.81 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  45.05 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  43.56 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 227 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0218  ABC transporter related  43.35 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  43.13 
 
 		 653 aa  162  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0941  ABC transporter related  46.31 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  42.86 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2804  ABC transporter component  44.44 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  40.78 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  40.67 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  40.89 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  46.23 
 
 		 227 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.29 
 
 		 227 aa  162  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  43.88 
 
 		 243 aa  161  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  44.44 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  45.27 
 
 		 232 aa  161  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  43.14 
 
 		 232 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  40.47 
 
 		 654 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4028  ABC transporter related  43.56 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  45.15 
 
 		 242 aa  161  9e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  39.09 
 
 		 220 aa  161  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2206  ABC transporter related  41.58 
 
 		 240 aa  161  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  45.15 
 
 		 242 aa  161  9e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  42.08 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0699  ABC transporter related  44.33 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  43.06 
 
 		 230 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  47.5 
 
 		 287 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  36.95 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4529  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein lolD  43.07 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  43.32 
 
 		 663 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1484  ABC transporter related protein  39.2 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4175  ABC transporter related  40.39 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  43.35 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  44.12 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  41.67 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>