More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3347 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3347  ABC transporter related  100 
 
 		 520 aa  1051    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.318773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3474  ABC transporter related  97.31 
 
 		 525 aa  1026    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3673  ABC transporter related  91.7 
 
 		 519 aa  944    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1635  ABC transporter related  51.08 
 
 		 530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02098  hypothetical protein  49.8 
 
 		 557 aa  487  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  31.76 
 
 		 571 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  31.28 
 
 		 581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.31 
 
 		 608 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.66 
 
 		 580 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2595  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  31.39 
 
 		 601 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398767  normal  0.0147502 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.33 
 
 		 556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  29.83 
 
 		 577 aa  164  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  31.62 
 
 		 578 aa  163  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0157  ABC transporter related  31.04 
 
 		 616 aa  162  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.542583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  29.2 
 
 		 575 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  29.62 
 
 		 596 aa  161  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  27.8 
 
 		 577 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2498  ABC transporter related  32.43 
 
 		 595 aa  160  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  34.66 
 
 		 598 aa  160  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.08 
 
 		 632 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.7 
 
 		 600 aa  158  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  40.95 
 
 		 625 aa  158  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  31.49 
 
 		 593 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  27.46 
 
 		 576 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.62 
 
 		 566 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  27.75 
 
 		 600 aa  157  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  33.53 
 
 		 627 aa  156  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  30.33 
 
 		 586 aa  156  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.4 
 
 		 600 aa  156  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  30.05 
 
 		 577 aa  156  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4995  ABC transporter, transmembrane region  29.7 
 
 		 605 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0356136  normal  0.528337 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  30.23 
 
 		 587 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.97 
 
 		 555 aa  155  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1895  ABC transporter related  29.83 
 
 		 581 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  42.22 
 
 		 574 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  42.22 
 
 		 574 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  29.91 
 
 		 579 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2899  ABC transporter related  34.41 
 
 		 601 aa  155  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0186152  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  27.81 
 
 		 566 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  32.39 
 
 		 776 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  32.02 
 
 		 722 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  30.51 
 
 		 586 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0762  ABC transporter related  30.15 
 
 		 605 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0733  ABC transporter related  30.12 
 
 		 605 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  33 
 
 		 598 aa  153  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.74 
 
 		 586 aa  153  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3848  ABC transporter related  29.71 
 
 		 585 aa  153  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135668  normal  0.677159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  27.48 
 
 		 606 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  36.77 
 
 		 552 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  32.39 
 
 		 607 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.59 
 
 		 619 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.78 
 
 		 596 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  28.22 
 
 		 588 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.75 
 
 		 586 aa  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  38.41 
 
 		 980 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  33.33 
 
 		 712 aa  151  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  38.22 
 
 		 582 aa  151  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  33.03 
 
 		 586 aa  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.33 
 
 		 639 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2254  ABC efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  43.08 
 
 		 578 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  29.26 
 
 		 593 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.87 
 
 		 591 aa  150  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2681  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  37.04 
 
 		 626 aa  150  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  28.37 
 
 		 612 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  28.37 
 
 		 612 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.87 
 
 		 609 aa  150  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  35.83 
 
 		 724 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  30.48 
 
 		 784 aa  150  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  35.83 
 
 		 724 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2002  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.4 
 
 		 597 aa  150  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  30.56 
 
 		 712 aa  150  7e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0400  ABC transporter  41.46 
 
 		 568 aa  150  7e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.429151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.3 
 
 		 586 aa  150  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  31.55 
 
 		 599 aa  150  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.84 
 
 		 641 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.3 
 
 		 586 aa  150  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  30.81 
 
 		 712 aa  149  9e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1636  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.42 
 
 		 568 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.77 
 
 		 586 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  31.49 
 
 		 596 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  34.97 
 
 		 566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  33.56 
 
 		 580 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  39.65 
 
 		 595 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.52 
 
 		 586 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  39.21 
 
 		 595 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1641  ABC transporter, transmembrane region, type 1  34.15 
 
 		 574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.88 
 
 		 568 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  29.08 
 
 		 600 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  28.38 
 
 		 610 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.03 
 
 		 627 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.1 
 
 		 576 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  36.18 
 
 		 606 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0928  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.59 
 
 		 595 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.141758 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  29.7 
 
 		 593 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0352  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydD  34.71 
 
 		 553 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.75 
 
 		 628 aa  149  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  36.33 
 
 		 601 aa  148  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.73 
 
 		 588 aa  148  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  38.5 
 
 		 578 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.83 
 
 		 600 aa  148  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>