More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3673 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3347  ABC transporter related  91.7 
 
 		 520 aa  966    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.318773  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3673  ABC transporter related  100 
 
 		 519 aa  1051    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3474  ABC transporter related  90.73 
 
 		 525 aa  961    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1635  ABC transporter related  50.29 
 
 		 530 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02098  hypothetical protein  49.8 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  30.43 
 
 		 581 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2595  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  31.91 
 
 		 601 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398767  normal  0.0147502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  31.99 
 
 		 571 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  31.48 
 
 		 575 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  30.5 
 
 		 577 aa  166  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  29.25 
 
 		 577 aa  166  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.39 
 
 		 608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.06 
 
 		 580 aa  161  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  32.83 
 
 		 625 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  30.2 
 
 		 596 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  42.92 
 
 		 574 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  42.92 
 
 		 574 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.45 
 
 		 632 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  30.85 
 
 		 578 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0157  ABC transporter related  33.22 
 
 		 616 aa  157  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.542583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.63 
 
 		 556 aa  157  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  42.22 
 
 		 598 aa  156  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2498  ABC transporter related  33.12 
 
 		 595 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.45 
 
 		 600 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  31.55 
 
 		 598 aa  155  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  36.77 
 
 		 552 aa  154  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.1 
 
 		 555 aa  153  5.9999999999999996e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 586 aa  153  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  36.3 
 
 		 593 aa  153  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  26.54 
 
 		 576 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.93 
 
 		 619 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.12 
 
 		 596 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  31.63 
 
 		 586 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.39 
 
 		 639 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.02 
 
 		 524 aa  151  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  30 
 
 		 587 aa  152  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  38.33 
 
 		 582 aa  151  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.72 
 
 		 605 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  29.47 
 
 		 612 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  28.76 
 
 		 579 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  38.55 
 
 		 980 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  29.47 
 
 		 612 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  32.34 
 
 		 584 aa  150  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  39.63 
 
 		 600 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  34.25 
 
 		 593 aa  150  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  31.23 
 
 		 574 aa  149  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.09 
 
 		 581 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  33.33 
 
 		 580 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  31.49 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.6 
 
 		 641 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.67 
 
 		 603 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1895  ABC transporter related  28.99 
 
 		 581 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1641  ABC transporter, transmembrane region, type 1  35.08 
 
 		 574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3237  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  41.63 
 
 		 631 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0279116 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.26 
 
 		 576 aa  149  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  35.82 
 
 		 566 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  35.17 
 
 		 627 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  30.03 
 
 		 704 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.45 
 
 		 628 aa  149  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  38.05 
 
 		 578 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.65 
 
 		 600 aa  148  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  30.96 
 
 		 588 aa  148  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.87 
 
 		 591 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  31.14 
 
 		 607 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0352  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydD  35.64 
 
 		 553 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.72 
 
 		 600 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.1 
 
 		 582 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.19 
 
 		 609 aa  147  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  28.19 
 
 		 609 aa  147  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  34.46 
 
 		 567 aa  147  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3848  ABC transporter related  30.77 
 
 		 585 aa  147  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135668  normal  0.677159 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.18 
 
 		 586 aa  146  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.19 
 
 		 567 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1636  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.83 
 
 		 568 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  30.07 
 
 		 593 aa  146  9e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  35.52 
 
 		 601 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  30.08 
 
 		 712 aa  146  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  27.27 
 
 		 587 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0400  ABC transporter  40.49 
 
 		 568 aa  145  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.429151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1312  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  33.67 
 
 		 589 aa  146  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743018  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0078  ABC transporter related  42.66 
 
 		 643 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.503479  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  27.27 
 
 		 587 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2002  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.85 
 
 		 597 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  29.44 
 
 		 573 aa  146  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.78 
 
 		 590 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37 
 
 		 614 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  35.51 
 
 		 606 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  31.78 
 
 		 776 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  36.33 
 
 		 722 aa  146  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.76 
 
 		 568 aa  145  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  37.17 
 
 		 595 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  29.9 
 
 		 712 aa  145  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.61 
 
 		 627 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  31.08 
 
 		 600 aa  145  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0040  ABC transporter related  35.62 
 
 		 550 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  31.4 
 
 		 624 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1216  transport ATP-binding protein CydC  40 
 
 		 548 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  37.39 
 
 		 572 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2899  ABC transporter related  33.09 
 
 		 601 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0186152  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  40.49 
 
 		 712 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>