More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1248 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  100 
 
 		 604 aa  1230    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  35.35 
 
 		 611 aa  346  7e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  32.77 
 
 		 623 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  31.59 
 
 		 603 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  31.59 
 
 		 603 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  29.65 
 
 		 592 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  32.81 
 
 		 614 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  31.9 
 
 		 625 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  31.3 
 
 		 625 aa  250  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  29.11 
 
 		 611 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  30.23 
 
 		 616 aa  246  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.13 
 
 		 600 aa  243  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  29.46 
 
 		 618 aa  242  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  31.2 
 
 		 626 aa  239  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  30.49 
 
 		 604 aa  237  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  29.17 
 
 		 609 aa  236  9e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  26.92 
 
 		 619 aa  233  8.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  29.37 
 
 		 613 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  30.86 
 
 		 596 aa  230  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  32.44 
 
 		 566 aa  229  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  29.84 
 
 		 613 aa  229  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  34.04 
 
 		 624 aa  228  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  27.98 
 
 		 618 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  28.19 
 
 		 618 aa  228  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  28.19 
 
 		 618 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  37.12 
 
 		 596 aa  226  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  29.8 
 
 		 599 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  27.95 
 
 		 618 aa  224  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  28.88 
 
 		 597 aa  223  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  29.19 
 
 		 621 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  29.03 
 
 		 594 aa  222  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  27.12 
 
 		 594 aa  222  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  40.82 
 
 		 625 aa  221  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  28.43 
 
 		 621 aa  220  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0029  ABC transporter ATP-binding protein  36.86 
 
 		 592 aa  219  8.999999999999998e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0444277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  30.39 
 
 		 611 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2524  ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 423 aa  219  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00646333  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  29.72 
 
 		 623 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  26.68 
 
 		 615 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  29.2 
 
 		 610 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  28.71 
 
 		 621 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  28.71 
 
 		 621 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  35.86 
 
 		 626 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  45.53 
 
 		 606 aa  213  9e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  28.29 
 
 		 606 aa  211  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  27.57 
 
 		 615 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  27.32 
 
 		 626 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  25.2 
 
 		 626 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  27.31 
 
 		 616 aa  207  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2522  ABC transporter, ATP-binding protein  32.4 
 
 		 608 aa  203  8e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000536848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3067  ABC transporter related  31.99 
 
 		 616 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000774728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  27.54 
 
 		 584 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  29.17 
 
 		 625 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  27.44 
 
 		 593 aa  200  7.999999999999999e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  28.38 
 
 		 605 aa  198  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1189  ABC transporter related  34.42 
 
 		 586 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00259948  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  27.57 
 
 		 619 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1517  ABC transporter related  40.32 
 
 		 622 aa  197  6e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  28.63 
 
 		 603 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  33.44 
 
 		 721 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  26.21 
 
 		 581 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1518  ABC transporter related  30.23 
 
 		 588 aa  194  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  27.45 
 
 		 638 aa  194  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  25.38 
 
 		 662 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1330  ABC transporter related  37.5 
 
 		 571 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.987639  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  29.34 
 
 		 601 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.38 
 
 		 603 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0234  ABC transporter ATP-binding protein  30.37 
 
 		 603 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.97 
 
 		 633 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2358  ABC transporter related  25.45 
 
 		 619 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.77 
 
 		 587 aa  188  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  30.57 
 
 		 724 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  30.57 
 
 		 724 aa  188  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  35.62 
 
 		 609 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.59 
 
 		 578 aa  187  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  33.51 
 
 		 727 aa  187  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.02 
 
 		 595 aa  187  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  26.6 
 
 		 605 aa  187  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  34.76 
 
 		 609 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.5 
 
 		 582 aa  186  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  35.95 
 
 		 609 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  26.75 
 
 		 638 aa  186  9e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.36 
 
 		 582 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  33.9 
 
 		 602 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  30.08 
 
 		 575 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  36.27 
 
 		 609 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  27.22 
 
 		 619 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0691  ABC transporter ATP-binding protein  38.6 
 
 		 609 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  26.82 
 
 		 608 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  40.66 
 
 		 759 aa  185  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  25.54 
 
 		 610 aa  186  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  27.65 
 
 		 622 aa  185  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2498  ABC transporter related  35.62 
 
 		 609 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.896627  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  38.59 
 
 		 588 aa  185  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.54 
 
 		 609 aa  186  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  28.71 
 
 		 601 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0526  TonB-dependent receptor  37.82 
 
 		 608 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.98 
 
 		 567 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  32.69 
 
 		 584 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  28.26 
 
 		 611 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>