More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0535 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0535  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
647 aa  1322    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.27 
 
 
556 aa  300  8e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  33.09 
 
 
588 aa  299  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.85 
 
 
585 aa  298  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  31.5 
 
 
618 aa  292  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.76 
 
 
602 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  33.33 
 
 
601 aa  280  7e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.74 
 
 
583 aa  278  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  30.6 
 
 
579 aa  276  7e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.65 
 
 
600 aa  276  9e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.96 
 
 
597 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.55 
 
 
582 aa  273  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.03 
 
 
577 aa  272  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.04 
 
 
582 aa  269  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.83 
 
 
582 aa  267  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  30.08 
 
 
611 aa  267  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  29.54 
 
 
611 aa  267  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  30.91 
 
 
612 aa  266  8e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  30.58 
 
 
575 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.48 
 
 
586 aa  265  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  30.87 
 
 
600 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  29.54 
 
 
571 aa  264  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  29.51 
 
 
611 aa  264  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2826  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  30.94 
 
 
604 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.070781 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  30.31 
 
 
571 aa  263  8e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  30.31 
 
 
582 aa  262  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.31 
 
 
582 aa  262  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.31 
 
 
582 aa  262  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.31 
 
 
582 aa  262  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.31 
 
 
582 aa  262  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  29.39 
 
 
611 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.79 
 
 
582 aa  262  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.96 
 
 
586 aa  263  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  30.31 
 
 
582 aa  262  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.31 
 
 
582 aa  262  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.79 
 
 
582 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.31 
 
 
582 aa  262  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.79 
 
 
582 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.31 
 
 
582 aa  262  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.31 
 
 
582 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.48 
 
 
575 aa  262  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0629  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  32.59 
 
 
587 aa  261  2e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  31.15 
 
 
609 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.31 
 
 
582 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.31 
 
 
582 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.31 
 
 
582 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.31 
 
 
582 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.86 
 
 
586 aa  261  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  31.14 
 
 
626 aa  260  6e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  30.56 
 
 
608 aa  260  7e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  29.64 
 
 
566 aa  259  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1638  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.69 
 
 
604 aa  259  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  30.54 
 
 
603 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.87 
 
 
582 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.46 
 
 
586 aa  258  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  31.14 
 
 
617 aa  258  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.75 
 
 
572 aa  258  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.84 
 
 
596 aa  257  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.26 
 
 
586 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.58 
 
 
586 aa  256  6e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1770  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.74 
 
 
607 aa  256  8e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0549134  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.12 
 
 
582 aa  256  8e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  30.66 
 
 
606 aa  256  9e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.86 
 
 
586 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.58 
 
 
586 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0117  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.32 
 
 
574 aa  256  1.0000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.58 
 
 
586 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1519  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.08 
 
 
581 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.47 
 
 
592 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  29.66 
 
 
634 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  30.45 
 
 
613 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.23 
 
 
587 aa  254  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0154  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.68 
 
 
585 aa  254  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2418  ABC transporter related  32.56 
 
 
585 aa  254  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.24 
 
 
582 aa  254  3e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.2758  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1683  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.68 
 
 
602 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1705  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.68 
 
 
602 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.433379  normal  0.881057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1668  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.68 
 
 
602 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2674  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.68 
 
 
602 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0832532  normal  0.0804565 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  29.98 
 
 
586 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  30.38 
 
 
586 aa  254  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  30.96 
 
 
615 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.38 
 
 
586 aa  254  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.73 
 
 
583 aa  253  6e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.21 
 
 
600 aa  253  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1819  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.49 
 
 
604 aa  253  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.372613  normal  0.63467 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.06 
 
 
587 aa  253  7e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  30.08 
 
 
639 aa  253  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  29.9 
 
 
649 aa  252  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  31.6 
 
 
624 aa  253  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  31.78 
 
 
578 aa  252  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.18 
 
 
583 aa  252  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  31.78 
 
 
578 aa  252  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.18 
 
 
618 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  31.18 
 
 
618 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2584  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.9 
 
 
600 aa  252  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.544743  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  30.17 
 
 
603 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  29.31 
 
 
598 aa  251  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  28.44 
 
 
588 aa  251  4e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.75 
 
 
613 aa  251  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>