More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3747 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3747  ABC transporter related  100 
 
 
565 aa  1155    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.903721  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.92 
 
 
1024 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.09 
 
 
1008 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.09 
 
 
1008 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  27.97 
 
 
582 aa  190  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.39 
 
 
603 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  29.4 
 
 
600 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  28.31 
 
 
598 aa  187  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  25.81 
 
 
646 aa  184  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.55 
 
 
641 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  26.72 
 
 
607 aa  184  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  30.08 
 
 
583 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  28 
 
 
640 aa  182  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.61 
 
 
639 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  27.61 
 
 
566 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  30.11 
 
 
619 aa  181  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  29.5 
 
 
588 aa  180  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0681  ABC transporter related  29.37 
 
 
575 aa  180  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0666  ABC transporter related  29.37 
 
 
575 aa  180  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  26.63 
 
 
556 aa  179  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  29.13 
 
 
609 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0921  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  29.11 
 
 
596 aa  178  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  29.3 
 
 
634 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.2 
 
 
566 aa  178  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0275  ABC transporter related protein  30.08 
 
 
651 aa  177  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  30.3 
 
 
586 aa  178  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  27.65 
 
 
582 aa  177  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0303  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.61 
 
 
575 aa  177  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.24 
 
 
1003 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  29.16 
 
 
606 aa  176  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  28.39 
 
 
595 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.74 
 
 
1001 aa  176  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  31.43 
 
 
579 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.77 
 
 
628 aa  176  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.36 
 
 
717 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  29.36 
 
 
614 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  29.41 
 
 
595 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.15 
 
 
1018 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.66 
 
 
1013 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.88 
 
 
632 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  29.25 
 
 
1018 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  29.32 
 
 
968 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.08 
 
 
629 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  29.57 
 
 
611 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.45 
 
 
580 aa  174  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1365  ABC transporter related  26.07 
 
 
621 aa  174  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000419806  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  31.18 
 
 
741 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  27.83 
 
 
595 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  26.5 
 
 
580 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.81 
 
 
627 aa  173  9e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  26.76 
 
 
585 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  31.18 
 
 
739 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.86 
 
 
582 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3140  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.18 
 
 
613 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15358  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.42 
 
 
597 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.56 
 
 
582 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  26.36 
 
 
666 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  28.69 
 
 
625 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.55 
 
 
590 aa  172  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.06 
 
 
579 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  30.75 
 
 
699 aa  172  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  28.9 
 
 
589 aa  171  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  31.18 
 
 
613 aa  171  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  28.51 
 
 
611 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18473  predicted protein  28.14 
 
 
645 aa  171  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.43 
 
 
632 aa  171  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  24.87 
 
 
582 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.87 
 
 
582 aa  171  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.87 
 
 
582 aa  171  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.87 
 
 
582 aa  171  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.87 
 
 
582 aa  171  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.87 
 
 
582 aa  171  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.09 
 
 
1018 aa  171  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1064  ABC transporter, transmembrane region  28.57 
 
 
602 aa  171  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.415501  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.87 
 
 
582 aa  171  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  24.87 
 
 
582 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.87 
 
 
582 aa  171  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  28.64 
 
 
619 aa  171  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  29.87 
 
 
586 aa  171  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.87 
 
 
582 aa  171  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.87 
 
 
582 aa  171  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.87 
 
 
582 aa  171  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.87 
 
 
582 aa  171  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.69 
 
 
593 aa  170  5e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  26.67 
 
 
613 aa  171  5e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.87 
 
 
582 aa  171  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  27.66 
 
 
598 aa  170  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  26.06 
 
 
587 aa  170  6e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.18 
 
 
578 aa  170  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.27 
 
 
582 aa  170  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  28.6 
 
 
571 aa  170  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  31.2 
 
 
591 aa  170  7e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  27.77 
 
 
586 aa  170  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.85 
 
 
609 aa  170  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.54 
 
 
586 aa  170  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  32.27 
 
 
976 aa  170  8e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  28.9 
 
 
590 aa  170  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3033  ABC transporter related  29.86 
 
 
598 aa  170  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.275745  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  29.1 
 
 
590 aa  170  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  28.07 
 
 
725 aa  170  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>