More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3033 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3033  ABC transporter related  100 
 
 		 598 aa  1162    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.275745  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2980  ABC transporter, transmembrane region  39.82 
 
 		 572 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2302  ABC transporter related  40.6 
 
 		 577 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2950  ABC transporter related  40.25 
 
 		 577 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.046002  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0757  ABC transporter related  44.57 
 
 		 578 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2470  ABC transporter related  40.42 
 
 		 577 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3466  efflux ABC transporter ATP-binding protein  41.5 
 
 		 569 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.734482 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  36.12 
 
 		 597 aa  327  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.84 
 
 		 598 aa  317  6e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.45 
 
 		 579 aa  303  6.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  33.94 
 
 		 598 aa  303  8.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  37.73 
 
 		 636 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  37.04 
 
 		 614 aa  300  5e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  32.68 
 
 		 584 aa  298  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  29.37 
 
 		 582 aa  294  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  33.39 
 
 		 587 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  33.87 
 
 		 602 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  36.56 
 
 		 567 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  34.73 
 
 		 585 aa  290  7e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  35.13 
 
 		 610 aa  290  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.13 
 
 		 609 aa  289  9e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.08 
 
 		 567 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.07 
 
 		 600 aa  289  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.23 
 
 		 597 aa  286  8e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  32.79 
 
 		 594 aa  286  8e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  37.04 
 
 		 601 aa  286  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.78 
 
 		 571 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  36.21 
 
 		 600 aa  285  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.97 
 
 		 571 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.97 
 
 		 571 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.97 
 
 		 571 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.97 
 
 		 571 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.42 
 
 		 571 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  35.54 
 
 		 566 aa  282  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  30.47 
 
 		 581 aa  282  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.78 
 
 		 571 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  34.05 
 
 		 623 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.73 
 
 		 571 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.51 
 
 		 577 aa  282  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  32.42 
 
 		 571 aa  281  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  34.95 
 
 		 601 aa  281  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  30.78 
 
 		 571 aa  281  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.78 
 
 		 571 aa  281  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.73 
 
 		 586 aa  280  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.75 
 
 		 567 aa  280  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.49 
 
 		 586 aa  280  7e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.85 
 
 		 586 aa  279  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  31.03 
 
 		 586 aa  279  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  36.2 
 
 		 606 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.67 
 
 		 586 aa  277  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.67 
 
 		 586 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.55 
 
 		 586 aa  277  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  33.09 
 
 		 616 aa  277  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  34.33 
 
 		 602 aa  276  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  30.67 
 
 		 586 aa  276  8e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.67 
 
 		 586 aa  276  8e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.85 
 
 		 586 aa  276  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  31.61 
 
 		 584 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  32 
 
 		 582 aa  274  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  33.28 
 
 		 594 aa  274  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  31.97 
 
 		 618 aa  273  7e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  34.18 
 
 		 588 aa  273  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.8 
 
 		 602 aa  272  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  33.95 
 
 		 565 aa  273  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  31.14 
 
 		 571 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  31.56 
 
 		 622 aa  272  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  34.66 
 
 		 622 aa  271  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  33.19 
 
 		 584 aa  270  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  32.8 
 
 		 764 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  28.91 
 
 		 578 aa  268  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  28.91 
 
 		 578 aa  268  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  28.83 
 
 		 609 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4878  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 991 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.360645  normal  0.0233171 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  31.63 
 
 		 572 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  30.25 
 
 		 577 aa  267  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  33.39 
 
 		 589 aa  267  5e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  32.57 
 
 		 593 aa  266  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.39 
 
 		 572 aa  266  8.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  34.41 
 
 		 614 aa  266  8.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  28.84 
 
 		 580 aa  265  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  33.78 
 
 		 773 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  33.22 
 
 		 764 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  29.54 
 
 		 580 aa  264  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  30.91 
 
 		 601 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3801  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 981 aa  263  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  29.74 
 
 		 575 aa  263  6.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  34.39 
 
 		 610 aa  263  8e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  33.27 
 
 		 600 aa  262  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  32.37 
 
 		 598 aa  262  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  33.75 
 
 		 611 aa  263  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  35.61 
 
 		 618 aa  262  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.12 
 
 		 613 aa  262  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  32.97 
 
 		 582 aa  262  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  30.66 
 
 		 588 aa  262  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.65 
 
 		 556 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  31.28 
 
 		 572 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  31.28 
 
 		 572 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  32.6 
 
 		 597 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.28 
 
 		 572 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  28.91 
 
 		 593 aa  261  3e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>