More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2980 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3466  efflux ABC transporter ATP-binding protein  70.43 
 
 		 569 aa  722    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.734482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0757  ABC transporter related  63.59 
 
 		 578 aa  642    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2980  ABC transporter, transmembrane region  100 
 
 		 572 aa  1132    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2470  ABC transporter related  69.96 
 
 		 577 aa  724    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2302  ABC transporter related  71.02 
 
 		 577 aa  755    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2950  ABC transporter related  71.2 
 
 		 577 aa  747    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.046002  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3033  ABC transporter related  39.96 
 
 		 598 aa  379  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.275745  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  35.82 
 
 		 585 aa  297  4e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  31.72 
 
 		 581 aa  291  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.77 
 
 		 597 aa  290  6e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  34.35 
 
 		 597 aa  285  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  35.05 
 
 		 870 aa  284  3.0000000000000004e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  31.89 
 
 		 580 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  31.59 
 
 		 584 aa  283  9e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  32.76 
 
 		 622 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  33.39 
 
 		 627 aa  278  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.1 
 
 		 671 aa  276  1.0000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.21 
 
 		 598 aa  274  4.0000000000000004e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  34.44 
 
 		 581 aa  273  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  32.29 
 
 		 622 aa  273  5.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.27 
 
 		 575 aa  273  6e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.3 
 
 		 586 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.3 
 
 		 586 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  30.3 
 
 		 586 aa  272  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  27.73 
 
 		 588 aa  271  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  31.53 
 
 		 638 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  32.59 
 
 		 614 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.12 
 
 		 586 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  30.12 
 
 		 586 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.12 
 
 		 586 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.55 
 
 		 586 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  32.91 
 
 		 584 aa  271  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  28.14 
 
 		 581 aa  270  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  32.48 
 
 		 587 aa  270  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  30.63 
 
 		 586 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.77 
 
 		 586 aa  270  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.77 
 
 		 586 aa  270  8e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  33.59 
 
 		 611 aa  269  8.999999999999999e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.95 
 
 		 586 aa  269  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  35.3 
 
 		 601 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  33.69 
 
 		 764 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  28.36 
 
 		 582 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  36.92 
 
 		 1284 aa  266  7e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  33.27 
 
 		 586 aa  266  8e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  32.91 
 
 		 768 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.81 
 
 		 628 aa  264  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  31.62 
 
 		 641 aa  264  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  33.77 
 
 		 598 aa  264  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  31.17 
 
 		 571 aa  264  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  28.04 
 
 		 590 aa  263  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.2 
 
 		 613 aa  263  8e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  30.8 
 
 		 571 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.8 
 
 		 571 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.8 
 
 		 571 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.8 
 
 		 571 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.63 
 
 		 578 aa  262  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.9 
 
 		 976 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.8 
 
 		 571 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.8 
 
 		 571 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  34.06 
 
 		 636 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.63 
 
 		 578 aa  262  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.1 
 
 		 597 aa  260  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.61 
 
 		 571 aa  260  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.8 
 
 		 571 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  32.73 
 
 		 614 aa  260  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  33.04 
 
 		 601 aa  260  6e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  32.74 
 
 		 623 aa  259  7e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.46 
 
 		 580 aa  259  7e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  32.1 
 
 		 610 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  32.1 
 
 		 610 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  30.75 
 
 		 556 aa  259  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  32.1 
 
 		 610 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  32.97 
 
 		 764 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  34.46 
 
 		 612 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.4 
 
 		 619 aa  258  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.73 
 
 		 609 aa  258  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  30.73 
 
 		 610 aa  258  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.61 
 
 		 571 aa  257  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.42 
 
 		 601 aa  257  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  34.41 
 
 		 635 aa  257  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  32.11 
 
 		 629 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3237  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.84 
 
 		 631 aa  256  6e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0279116 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  29.83 
 
 		 594 aa  256  7e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  32.91 
 
 		 770 aa  256  7e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  32.73 
 
 		 750 aa  256  9e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  30.99 
 
 		 601 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.15 
 
 		 578 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.11 
 
 		 1003 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.74 
 
 		 597 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  31.27 
 
 		 598 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  29.93 
 
 		 614 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  32.5 
 
 		 773 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.68 
 
 		 608 aa  256  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  29.86 
 
 		 613 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.83 
 
 		 650 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  30.66 
 
 		 578 aa  254  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  27.49 
 
 		 597 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  34.41 
 
 		 619 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0207  ABC transporter related  31.66 
 
 		 602 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.361271  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  29.69 
 
 		 930 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>