More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2331 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  49.79 
 
 		 1675 aa  723    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  52.73 
 
 		 734 aa  727    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  58.15 
 
 		 721 aa  845    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  52.71 
 
 		 748 aa  752    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  98.76 
 
 		 724 aa  1460    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  54.77 
 
 		 727 aa  820    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 724 aa  1478    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  48.58 
 
 		 727 aa  685    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  47.87 
 
 		 725 aa  685    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  45.33 
 
 		 1717 aa  663    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  44.71 
 
 		 715 aa  642    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  42.51 
 
 		 732 aa  587  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  44.04 
 
 		 731 aa  580  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  40.28 
 
 		 715 aa  504  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  33.57 
 
 		 721 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15711  hypothetical protein  33.94 
 
 		 731 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  34.17 
 
 		 726 aa  395  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  32.91 
 
 		 720 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.5 
 
 		 1019 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  34.73 
 
 		 1038 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  34.87 
 
 		 1038 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  33.01 
 
 		 1013 aa  356  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  33.8 
 
 		 906 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  33.8 
 
 		 906 aa  354  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  33.7 
 
 		 1040 aa  353  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.12 
 
 		 908 aa  349  9e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  33.47 
 
 		 908 aa  349  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  33.19 
 
 		 1011 aa  348  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  31.07 
 
 		 737 aa  345  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  33.61 
 
 		 743 aa  340  5.9999999999999996e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  31.02 
 
 		 721 aa  337  5e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.48 
 
 		 1018 aa  330  8e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  31.89 
 
 		 1018 aa  324  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  31.18 
 
 		 1042 aa  323  5e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  30.01 
 
 		 727 aa  323  5e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.76 
 
 		 1018 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.19 
 
 		 738 aa  319  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  29.66 
 
 		 733 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  31.84 
 
 		 712 aa  318  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  29.25 
 
 		 734 aa  317  5e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  29.11 
 
 		 734 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8163  ABC transporter related  31.46 
 
 		 767 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  28.09 
 
 		 739 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  31.8 
 
 		 892 aa  309  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  30.76 
 
 		 721 aa  307  6e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  30.52 
 
 		 704 aa  306  6e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.99 
 
 		 717 aa  306  7e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  30.52 
 
 		 704 aa  306  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.52 
 
 		 704 aa  306  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  30 
 
 		 726 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  30.39 
 
 		 725 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  31.3 
 
 		 723 aa  304  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  29.06 
 
 		 695 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  31.3 
 
 		 723 aa  304  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  30.71 
 
 		 719 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  29.38 
 
 		 699 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  28.33 
 
 		 760 aa  303  7.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  29.78 
 
 		 719 aa  302  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  27.96 
 
 		 725 aa  301  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  31.64 
 
 		 719 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  27.75 
 
 		 727 aa  300  8e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  29.44 
 
 		 730 aa  299  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.99 
 
 		 759 aa  296  6e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  32.67 
 
 		 699 aa  296  1e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.04 
 
 		 1024 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  31.28 
 
 		 705 aa  295  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  29.1 
 
 		 726 aa  295  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.95 
 
 		 770 aa  293  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  30.75 
 
 		 753 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  34.77 
 
 		 700 aa  293  8e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  30.75 
 
 		 772 aa  293  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  28.35 
 
 		 721 aa  293  9e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  28.69 
 
 		 747 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  30.55 
 
 		 753 aa  293  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  29.14 
 
 		 741 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  31.75 
 
 		 731 aa  290  7e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.46 
 
 		 753 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  30.46 
 
 		 753 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  30.46 
 
 		 753 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  30.46 
 
 		 753 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  30.07 
 
 		 726 aa  289  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  29.06 
 
 		 739 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  30.59 
 
 		 739 aa  287  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  29.39 
 
 		 721 aa  287  5.999999999999999e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  30.01 
 
 		 724 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.73 
 
 		 1000 aa  285  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  27.31 
 
 		 738 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  30.01 
 
 		 724 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  30.16 
 
 		 986 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  30.5 
 
 		 743 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  28.15 
 
 		 741 aa  284  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  30.74 
 
 		 707 aa  283  6.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.99 
 
 		 720 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  28.12 
 
 		 716 aa  283  1e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  30.88 
 
 		 707 aa  281  3e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  29.73 
 
 		 980 aa  281  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  30.36 
 
 		 725 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  33.39 
 
 		 865 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  27.52 
 
 		 722 aa  279  2e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  30.35 
 
 		 750 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>