More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2503 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  100 
 
 
715 aa  1441    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  44.63 
 
 
748 aa  613  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  46.42 
 
 
734 aa  608  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  45.72 
 
 
1675 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  42.96 
 
 
721 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  41.76 
 
 
1717 aa  570  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  43.32 
 
 
727 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  42.8 
 
 
725 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  40.36 
 
 
727 aa  554  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  40 
 
 
724 aa  529  1e-149  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  40.31 
 
 
732 aa  530  1e-149  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  40.14 
 
 
724 aa  527  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  38.62 
 
 
715 aa  518  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  42.02 
 
 
731 aa  510  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15711  hypothetical protein  33.8 
 
 
731 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  34.3 
 
 
726 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  36.26 
 
 
721 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  34.54 
 
 
720 aa  365  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  32.78 
 
 
1038 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  32.64 
 
 
1038 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  35.1 
 
 
743 aa  352  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  29.22 
 
 
737 aa  347  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.08 
 
 
1019 aa  347  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  31.92 
 
 
1042 aa  330  7e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  31.39 
 
 
906 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 
906 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.75 
 
 
738 aa  316  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.46 
 
 
1018 aa  307  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.82 
 
 
908 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.62 
 
 
1013 aa  300  5e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  27.97 
 
 
739 aa  299  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  29.83 
 
 
908 aa  298  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  29.97 
 
 
1018 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  30.54 
 
 
1011 aa  293  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  29.7 
 
 
1040 aa  290  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.95 
 
 
1018 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  27.54 
 
 
695 aa  287  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  27.48 
 
 
738 aa  287  5.999999999999999e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  28.77 
 
 
727 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  29.18 
 
 
725 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  29.21 
 
 
734 aa  284  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  29.21 
 
 
734 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  28.91 
 
 
722 aa  283  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  28.41 
 
 
721 aa  281  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  27.82 
 
 
727 aa  281  4e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  28.37 
 
 
704 aa  279  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  28.37 
 
 
704 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.37 
 
 
704 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  28.97 
 
 
715 aa  277  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  31.82 
 
 
719 aa  277  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  29.54 
 
 
726 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  31.15 
 
 
739 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  27.35 
 
 
760 aa  274  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  28.67 
 
 
722 aa  274  4.0000000000000004e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  27.81 
 
 
699 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  28.02 
 
 
721 aa  272  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  31.29 
 
 
719 aa  271  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  26.87 
 
 
726 aa  270  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  26.27 
 
 
717 aa  267  4e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  28.17 
 
 
730 aa  266  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  30.23 
 
 
712 aa  266  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  31.23 
 
 
726 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  27.87 
 
 
733 aa  264  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.8 
 
 
753 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  29.8 
 
 
772 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.8 
 
 
753 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  27.5 
 
 
741 aa  261  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.94 
 
 
770 aa  261  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  27.61 
 
 
759 aa  260  7e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  30.33 
 
 
726 aa  260  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.32 
 
 
753 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  30.46 
 
 
728 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.32 
 
 
753 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  27.85 
 
 
722 aa  259  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.32 
 
 
753 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.32 
 
 
753 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  29.31 
 
 
731 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  30.32 
 
 
728 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  28.37 
 
 
724 aa  258  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  28.37 
 
 
724 aa  258  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  28.71 
 
 
725 aa  258  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  26.13 
 
 
747 aa  258  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  30.18 
 
 
721 aa  257  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  29.15 
 
 
714 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.25 
 
 
1000 aa  254  5.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  27.07 
 
 
737 aa  253  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  27.24 
 
 
721 aa  253  8.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4071  ABC transporter related  30.8 
 
 
723 aa  253  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0571162  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  29.64 
 
 
716 aa  252  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  28.1 
 
 
726 aa  253  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1653  lantibiotic transporter containing removal activity of leader peptide  27.93 
 
 
745 aa  251  3e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  28.14 
 
 
723 aa  251  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  28.14 
 
 
723 aa  251  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  28.9 
 
 
707 aa  250  5e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  29.64 
 
 
741 aa  250  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  28.79 
 
 
725 aa  249  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  30.49 
 
 
714 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  28.71 
 
 
739 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  26.75 
 
 
736 aa  248  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  28.76 
 
 
707 aa  248  3e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>