More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4598 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4598  ABC transporter related  100 
 
 		 293 aa  583  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3788  ABC transporter related  68.65 
 
 		 290 aa  343  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1417  ABC transporter related  59.73 
 
 		 254 aa  272  5.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2105  ABC transporter related  61.04 
 
 		 256 aa  271  7e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1822  ABC methionine transporter, ATPase subunit MetN  60.61 
 
 		 256 aa  268  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.876505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.46 
 
 		 344 aa  250  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 350 aa  250  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.07 
 
 		 344 aa  249  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  50.94 
 
 		 368 aa  249  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  54.02 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  50 
 
 		 344 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  53.72 
 
 		 347 aa  245  6.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1681  ABC transporter related  55.32 
 
 		 338 aa  245  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000123006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  52.74 
 
 		 347 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.51 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6304  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.72 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2298  ABC transporter related  55.32 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  53.3 
 
 		 344 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23470  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  52.63 
 
 		 349 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00129815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  50.4 
 
 		 342 aa  242  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.31 
 
 		 343 aa  242  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2221  ABC transporter related  52.72 
 
 		 340 aa  242  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.81 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72620  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.89 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.89 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  47.76 
 
 		 346 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2419  ABC transporter component  50.57 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0160  ABC transporter related  46.59 
 
 		 346 aa  240  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.31 
 
 		 343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2534  ABC transporter related protein  52.3 
 
 		 340 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0196  ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 346 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000216687  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.89 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.89 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.89 
 
 		 343 aa  239  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.31 
 
 		 343 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0218  ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 		 346 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.31 
 
 		 343 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.31 
 
 		 343 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.31 
 
 		 343 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.05 
 
 		 344 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3652  ABC transporter related  56 
 
 		 339 aa  238  9e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2398  ABC transporter related  54.89 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.5 
 
 		 344 aa  237  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.48 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  53.57 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0176  ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00383755  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0166  ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.766032  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.5 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0174  ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.157332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0195  ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.95 
 
 		 385 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  54.91 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.87 
 
 		 343 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.95 
 
 		 385 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.95 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5127  ABC transporter, ATP-binding protein  46.27 
 
 		 346 aa  236  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  52.07 
 
 		 343 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.5 
 
 		 385 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.4 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  51.24 
 
 		 340 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.4 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5262  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 		 335 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0065  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.07 
 
 		 335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.42 
 
 		 335 aa  235  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0250  ABC transporter related protein  53.88 
 
 		 400 aa  235  8e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  52.48 
 
 		 343 aa  234  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.48 
 
 		 343 aa  234  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  52.48 
 
 		 343 aa  234  9e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.48 
 
 		 343 aa  234  9e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.48 
 
 		 343 aa  234  9e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.48 
 
 		 343 aa  234  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.48 
 
 		 343 aa  234  9e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.48 
 
 		 343 aa  234  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.48 
 
 		 343 aa  234  9e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  52.07 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2742  ABC transporter related  56.5 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2785  ABC transporter related  50.84 
 
 		 359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  52.72 
 
 		 351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4503  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.07 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0496  ABC transporter related  50.67 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000100343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2661  ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1547  ABC transporter ATP-binding protein  56.5 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0483  ABC transporter related  50.67 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000112326  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2301  ABC transporter related  53.95 
 
 		 392 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4687  ABC transporter related  56.7 
 
 		 391 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00669309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  53.62 
 
 		 354 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5216  ABC transporter related  57.14 
 
 		 391 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  51.24 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1797  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.81 
 
 		 341 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1342  ABC transporter related  54.35 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2019  ABC transporter related  53.36 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000471026 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  56.44 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  56.44 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.41 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0233022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2536  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.74 
 
 		 352 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0300192  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.24 
 
 		 335 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0131  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.24 
 
 		 335 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  56.44 
 
 		 392 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.24 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182422  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.24 
 
 		 335 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>