More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1342 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1342  ABC transporter related  100 
 
 		 263 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2630  ABC transporter related  84.03 
 
 		 263 aa  431  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2336  ABC transporter-like  67.05 
 
 		 266 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1547  ABC transporter ATP-binding protein  71.07 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2742  ABC transporter related  71.07 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2661  ABC transporter, ATP-binding protein  71.07 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  60 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  56.43 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  56.75 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  64 
 
 		 342 aa  274  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  55.56 
 
 		 351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  57.2 
 
 		 354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  54.76 
 
 		 340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  58.22 
 
 		 342 aa  271  6e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  56.8 
 
 		 394 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  56.8 
 
 		 394 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.78 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0233022 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  56.8 
 
 		 392 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3393  ABC transporter related  56.4 
 
 		 391 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0311  ABC metal ion transporter, ATPase subunit  56.4 
 
 		 398 aa  269  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  52.63 
 
 		 342 aa  269  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3856  DL-methionine transporter subunit  57.14 
 
 		 274 aa  268  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  53.11 
 
 		 339 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2681  ABC transporter related  56.3 
 
 		 372 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  52.7 
 
 		 339 aa  267  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.27 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3160  ABC transporter related protein  57.85 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0152583 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.95 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  56.52 
 
 		 352 aa  266  4e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  51.28 
 
 		 345 aa  265  5.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.81 
 
 		 344 aa  265  5.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 339 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  56.89 
 
 		 341 aa  265  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  52.7 
 
 		 339 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 339 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  52.7 
 
 		 339 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  52.28 
 
 		 339 aa  264  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.28 
 
 		 344 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.28 
 
 		 385 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.28 
 
 		 345 aa  264  1e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.87 
 
 		 344 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.28 
 
 		 385 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  52.28 
 
 		 339 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.18 
 
 		 335 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  56.44 
 
 		 341 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  56.44 
 
 		 341 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  52.28 
 
 		 339 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  56.39 
 
 		 343 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.66 
 
 		 344 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5216  ABC transporter related  56.5 
 
 		 391 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329969 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.5 
 
 		 343 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.87 
 
 		 344 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.5 
 
 		 343 aa  263  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  56 
 
 		 341 aa  262  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  52.28 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.06 
 
 		 343 aa  262  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3248  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  59.64 
 
 		 320 aa  262  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.47 
 
 		 344 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0546  methionine ABC transporter ATP-binding protein  54.58 
 
 		 405 aa  261  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.87 
 
 		 385 aa  261  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0448  methionine ABC transporter ATP-binding protein  55.02 
 
 		 404 aa  261  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  56 
 
 		 341 aa  261  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1867  ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 380 aa  261  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0621935  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.47 
 
 		 344 aa  261  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  56 
 
 		 341 aa  261  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 		 341 aa  261  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  59.23 
 
 		 369 aa  261  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0858  methionine ABC transporter ATP-binding protein  55.02 
 
 		 404 aa  261  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2174  methionine ABC transporter ATP-binding protein  55.02 
 
 		 404 aa  261  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 		 341 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 		 341 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1439  ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 361 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0350  ABC transporter  55.02 
 
 		 376 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100794  normal  0.782008 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  50 
 
 		 350 aa  261  6.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  51.12 
 
 		 344 aa  261  8e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  55.79 
 
 		 337 aa  261  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  56 
 
 		 343 aa  261  8.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0220  ABC transporter ATP-binding protein  54.37 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333916  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0244  ABC transporter related  56.15 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2419  ABC transporter component  53.88 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.28 
 
 		 344 aa  260  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4687  ABC transporter related  55.92 
 
 		 391 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00669309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1908  ABC transporter-like protein  55.92 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.103908 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1771  ABC transporter related  52.57 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237525  hitchhiker  0.000187341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.66 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.28 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.28 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03093  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.89 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.28 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.85 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.28 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.28 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0235  ABC transporter related  54.37 
 
 		 369 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.28 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.28 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  55.51 
 
 		 397 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.76 
 
 		 377 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2365  ABC transporter related  52.01 
 
 		 365 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0817479  hitchhiker  0.00312127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>