More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2419 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2419  ABC transporter component  100 
 
 
258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  63.52 
 
 
377 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  66.39 
 
 
368 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  62.55 
 
 
356 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  62.86 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4687  ABC transporter related  62.8 
 
 
391 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00669309  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5216  ABC transporter related  63.2 
 
 
391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329969 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  63.2 
 
 
392 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0311  ABC metal ion transporter, ATPase subunit  62.8 
 
 
398 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  62.45 
 
 
385 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  62.8 
 
 
394 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  62.8 
 
 
394 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0853  ABC methionine transporter, ATPase subunit  61.38 
 
 
386 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00389788  hitchhiker  0.00726443 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3393  ABC transporter related  62.4 
 
 
391 aa  299  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  62.04 
 
 
344 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.87 
 
 
344 aa  298  7e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  62.45 
 
 
350 aa  297  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0220  ABC transporter ATP-binding protein  58.4 
 
 
369 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333916  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 
344 aa  296  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0235  ABC transporter related  58.4 
 
 
369 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  59.27 
 
 
345 aa  296  3e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  62.1 
 
 
348 aa  295  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  62.1 
 
 
348 aa  295  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  61.63 
 
 
344 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  61.54 
 
 
349 aa  294  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0858  methionine ABC transporter ATP-binding protein  60.56 
 
 
404 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  61.54 
 
 
349 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1439  ABC transporter, ATP-binding protein  60.56 
 
 
361 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  61.63 
 
 
344 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4539  ABC transporter related  60.32 
 
 
386 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342354  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2174  methionine ABC transporter ATP-binding protein  60.56 
 
 
404 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  61.22 
 
 
344 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.82 
 
 
344 aa  292  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  59.38 
 
 
348 aa  292  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0546  methionine ABC transporter ATP-binding protein  61.22 
 
 
405 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1867  ABC transporter, ATP-binding protein  61.22 
 
 
380 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0621935  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0448  methionine ABC transporter ATP-binding protein  61.22 
 
 
404 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.82 
 
 
385 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.82 
 
 
385 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.41 
 
 
344 aa  291  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  61.22 
 
 
344 aa  291  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.82 
 
 
344 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.82 
 
 
344 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.82 
 
 
344 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.82 
 
 
344 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.82 
 
 
344 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.82 
 
 
344 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.82 
 
 
344 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  57.2 
 
 
344 aa  290  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  56.28 
 
 
340 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.82 
 
 
344 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  62.55 
 
 
382 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.44 
 
 
344 aa  290  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0233022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4992  ABC transporter related  57.2 
 
 
369 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31520  ABC transporter, ATP-binding component  58.8 
 
 
385 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.05 
 
 
344 aa  289  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0244  ABC transporter related  57.2 
 
 
369 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177795  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.87 
 
 
343 aa  289  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.87 
 
 
343 aa  289  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5188  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  56.8 
 
 
343 aa  288  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  59.59 
 
 
344 aa  287  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  58.02 
 
 
340 aa  287  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.97 
 
 
343 aa  287  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4503  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.77 
 
 
335 aa  287  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  58.47 
 
 
343 aa  286  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.47 
 
 
343 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  58.47 
 
 
343 aa  286  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.47 
 
 
343 aa  286  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.47 
 
 
343 aa  286  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.47 
 
 
343 aa  286  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  59.11 
 
 
359 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.47 
 
 
343 aa  286  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.47 
 
 
343 aa  286  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.47 
 
 
343 aa  286  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.47 
 
 
343 aa  286  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5613  ABC transporter related  62.14 
 
 
388 aa  286  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.370742 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  58.06 
 
 
343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.47 
 
 
343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.47 
 
 
343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.47 
 
 
343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.47 
 
 
343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.47 
 
 
343 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.83 
 
 
343 aa  285  5e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  54.32 
 
 
339 aa  285  5e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2365  ABC transporter related  57.14 
 
 
365 aa  285  5e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0817479  hitchhiker  0.00312127 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  58.44 
 
 
345 aa  283  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2536  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.39 
 
 
352 aa  283  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0300192  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  62.16 
 
 
337 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  55.56 
 
 
374 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  62.61 
 
 
351 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  53.5 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3856  DL-methionine transporter subunit  58.26 
 
 
274 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 
339 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  54.25 
 
 
346 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  58.37 
 
 
342 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.66 
 
 
343 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1772  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.78 
 
 
348 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  58 
 
 
369 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2912  ABC transporter ATP-binding protein  57.6 
 
 
366 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  53.5 
 
 
339 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>