More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2630 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2630  ABC transporter related  100 
 
 
263 aa  520  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1342  ABC transporter related  84.03 
 
 
263 aa  431  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2336  ABC transporter-like  68.58 
 
 
266 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2742  ABC transporter related  72.31 
 
 
328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2661  ABC transporter, ATP-binding protein  72.31 
 
 
328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1547  ABC transporter ATP-binding protein  72.31 
 
 
328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2681  ABC transporter related  61.76 
 
 
372 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  57.26 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  58.51 
 
 
344 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  58.51 
 
 
347 aa  278  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  60 
 
 
354 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  59.11 
 
 
344 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  59.11 
 
 
385 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  59.11 
 
 
385 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2912  ABC transporter ATP-binding protein  60.49 
 
 
366 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  60.49 
 
 
369 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0244  ABC transporter related  57.61 
 
 
369 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177795  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  59.68 
 
 
342 aa  275  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0220  ABC transporter ATP-binding protein  56.97 
 
 
369 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333916  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  55.19 
 
 
339 aa  275  6e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3856  DL-methionine transporter subunit  58.4 
 
 
274 aa  275  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0235  ABC transporter related  56.97 
 
 
369 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  55.6 
 
 
342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.3 
 
 
344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.3 
 
 
344 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.09 
 
 
344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  56.56 
 
 
342 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.3 
 
 
344 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  52.89 
 
 
350 aa  272  5.000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.89 
 
 
385 aa  271  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  53.11 
 
 
347 aa  271  8.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  54.77 
 
 
339 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  54.77 
 
 
339 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.49 
 
 
344 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.61 
 
 
343 aa  270  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4992  ABC transporter related  55.74 
 
 
369 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.87 
 
 
344 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  54.77 
 
 
339 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  54.77 
 
 
339 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  57.94 
 
 
392 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  54.77 
 
 
339 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.19 
 
 
331 aa  269  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  54.37 
 
 
340 aa  269  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  57.94 
 
 
394 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  57.94 
 
 
394 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  54.36 
 
 
339 aa  269  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.77 
 
 
343 aa  268  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  54.36 
 
 
339 aa  268  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  54.36 
 
 
339 aa  268  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0311  ABC metal ion transporter, ATPase subunit  57.94 
 
 
398 aa  268  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.77 
 
 
343 aa  268  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3531  ABC transporter related protein  50.83 
 
 
341 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1908  ABC transporter-like protein  59.17 
 
 
318 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.103908 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3160  ABC transporter related protein  57.31 
 
 
332 aa  268  7e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0152583 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  54.36 
 
 
339 aa  268  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  54.36 
 
 
339 aa  268  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  60.53 
 
 
337 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.82 
 
 
377 aa  267  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2419  ABC transporter component  55.51 
 
 
258 aa  266  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.49 
 
 
344 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3393  ABC transporter related  57.54 
 
 
391 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.36 
 
 
343 aa  265  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5188  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  55.97 
 
 
343 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.87 
 
 
344 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.53 
 
 
345 aa  266  4e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7234  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.56 
 
 
384 aa  265  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.09 
 
 
344 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.09 
 
 
344 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0350  ABC transporter  55.56 
 
 
376 aa  265  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100794  normal  0.782008 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.09 
 
 
344 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.09 
 
 
344 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.19 
 
 
344 aa  265  5e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.09 
 
 
344 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.09 
 
 
344 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.09 
 
 
344 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  55.6 
 
 
343 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  54.77 
 
 
344 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  56.07 
 
 
343 aa  265  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  56.02 
 
 
345 aa  265  5.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.88 
 
 
344 aa  265  5.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0233022 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  55.6 
 
 
343 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.6 
 
 
343 aa  265  7e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.6 
 
 
343 aa  265  7e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  55.6 
 
 
343 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.6 
 
 
343 aa  265  7e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4225  ABC transporter related  58.33 
 
 
384 aa  265  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00831393 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.6 
 
 
343 aa  265  7e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.11 
 
 
344 aa  265  7e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.6 
 
 
343 aa  265  7e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.6 
 
 
343 aa  265  8e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1681  ABC transporter related  56.2 
 
 
338 aa  264  8.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000123006  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2221  ABC transporter related  57.08 
 
 
340 aa  264  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  53.23 
 
 
341 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  55.97 
 
 
374 aa  264  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.47 
 
 
344 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  56.15 
 
 
351 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5216  ABC transporter related  57.14 
 
 
391 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329969 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2534  ABC transporter related protein  57.51 
 
 
340 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3248  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  60.54 
 
 
320 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  57.78 
 
 
343 aa  262  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>