More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2562 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  82.12 
 
 
276 aa  475  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  65.33 
 
 
278 aa  392  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0092  ABC transporter related  65.33 
 
 
282 aa  381  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  55.42 
 
 
242 aa  269  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1861  ABC transporter related  52.09 
 
 
265 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00288336  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1453  ATPase  48.28 
 
 
269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0819756  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  47.58 
 
 
255 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  47.2 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1764  ABC transporter related  45.31 
 
 
248 aa  207  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000974865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0493  ABC transporter, ATPase subunit  41.85 
 
 
262 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2303  ABC transporter related  42.59 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0860  ABC transporter related  38.49 
 
 
249 aa  195  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000637207  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.51 
 
 
411 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.68 
 
 
266 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0521  ABC transporter related  41.6 
 
 
258 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  40.33 
 
 
254 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  40.89 
 
 
398 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 
249 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.13 
 
 
403 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11110  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  46.92 
 
 
238 aa  190  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0035018  normal  0.0238039 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0526  ABC transporter-related protein  42.4 
 
 
253 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0304047  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.34 
 
 
402 aa  186  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  41.39 
 
 
252 aa  185  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  41.06 
 
 
283 aa  185  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.25 
 
 
541 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2035  ABC transporter related  41.53 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.84 
 
 
278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  37.4 
 
 
380 aa  182  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.04 
 
 
277 aa  182  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.52 
 
 
278 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.22 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.96 
 
 
281 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2799  ABC type ATPase  38.72 
 
 
261 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  40.17 
 
 
283 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.94 
 
 
403 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  40.17 
 
 
283 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.52 
 
 
250 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  41.02 
 
 
287 aa  176  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  39.84 
 
 
568 aa  175  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.55 
 
 
281 aa  175  9e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.41 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0064  ABC transporter-related protein  39.33 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00037782  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.16 
 
 
440 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.25 
 
 
284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.15 
 
 
270 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 
395 aa  172  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.8 
 
 
283 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 
453 aa  170  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.14 
 
 
277 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  41.43 
 
 
288 aa  169  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.97 
 
 
257 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  36.63 
 
 
258 aa  168  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38 
 
 
284 aa  168  8e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.56 
 
 
252 aa  168  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.03 
 
 
256 aa  168  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  38.37 
 
 
456 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.59 
 
 
281 aa  167  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  40.76 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.6 
 
 
256 aa  166  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  35.53 
 
 
571 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.26 
 
 
274 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  38.24 
 
 
255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.96 
 
 
271 aa  165  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  37.82 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.39 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  36.94 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  35.27 
 
 
568 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.06 
 
 
288 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.42 
 
 
255 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.43 
 
 
310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  41.26 
 
 
232 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.37 
 
 
285 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3138  ABC transporter related  40.18 
 
 
221 aa  162  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  36.36 
 
 
282 aa  161  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.77 
 
 
244 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.13 
 
 
253 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.1 
 
 
250 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.43 
 
 
286 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.96 
 
 
285 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.66 
 
 
255 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  37.34 
 
 
574 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 
243 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.59 
 
 
281 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.44 
 
 
243 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.21 
 
 
280 aa  159  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  34.92 
 
 
284 aa  158  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.6 
 
 
259 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  40.09 
 
 
218 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  39.73 
 
 
810 aa  157  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0332  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.09 
 
 
237 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.105334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.31 
 
 
248 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.44 
 
 
244 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.52 
 
 
285 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.91 
 
 
276 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 
279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  37.55 
 
 
240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0999  ABC transporter related  36.48 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0187687  normal  0.71455 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.29 
 
 
285 aa  155  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>