More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0748 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0748  ABC transporter related  100 
 
 		 333 aa  631  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31190  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  59.65 
 
 		 348 aa  349  5e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264527  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3807  ABC transporter related  56.73 
 
 		 354 aa  286  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0316  ABC transporter related  55.1 
 
 		 342 aa  275  7e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.000000000465057  decreased coverage  0.0034539 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04180  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  62.27 
 
 		 379 aa  275  8e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.40669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0180  ABC transporter related protein  54.44 
 
 		 352 aa  275  9e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0435  ABC transporter related  52.73 
 
 		 332 aa  269  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3054  ABC transporter related protein  54.31 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.374773  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3746  ABC transporter related  52.74 
 
 		 346 aa  256  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  43.82 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  45.42 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  44.56 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.43 
 
 		 386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  50.43 
 
 		 386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.43 
 
 		 386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 		 390 aa  235  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  50 
 
 		 386 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  51.28 
 
 		 346 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  51.28 
 
 		 346 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  51.28 
 
 		 346 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  49.37 
 
 		 357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2023  ABC transporter related  39.54 
 
 		 366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.14 
 
 		 402 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  39.88 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3334  ABC transporter related protein  60.25 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150349  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0220  ABC transporter related protein  62.15 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4663  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.88 
 
 		 387 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.43 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  49.37 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  43.83 
 
 		 347 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  47.96 
 
 		 356 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.59 
 
 		 372 aa  232  8.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0939  ABC putrescine transporter, ATPase subunit PotG  40.57 
 
 		 387 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301968  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.79 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  45.23 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4355  ABC transporter related  48.99 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.16 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  50.86 
 
 		 362 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.48 
 
 		 370 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  52.14 
 
 		 527 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0823  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.14 
 
 		 376 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  47.74 
 
 		 328 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 363 aa  229  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0496  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  50.84 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.43 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.21 
 
 		 384 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.21 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3044  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.21 
 
 		 384 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.21 
 
 		 384 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  45.3 
 
 		 350 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1735  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.86 
 
 		 368 aa  228  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000353928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  49.57 
 
 		 388 aa  228  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  47.37 
 
 		 328 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6066  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.64 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.21 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 		 387 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.66 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6346  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  47.21 
 
 		 384 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2813  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  47.21 
 
 		 384 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1949  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.07 
 
 		 384 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.415824  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5898  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.69 
 
 		 371 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  41.98 
 
 		 330 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.16 
 
 		 378 aa  227  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.64 
 
 		 384 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  46.07 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.29 
 
 		 354 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.26 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.07 
 
 		 357 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  51.87 
 
 		 348 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0015  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  48.07 
 
 		 365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7682  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  47.21 
 
 		 379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.3686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  50.6 
 
 		 364 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.83 
 
 		 382 aa  226  6e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0725  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.88 
 
 		 384 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0633  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.88 
 
 		 384 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375714  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2019  putrescine ABC transport system, ATP-binding protein  40.88 
 
 		 384 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2941  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.71 
 
 		 388 aa  226  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.12 
 
 		 370 aa  225  7e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.8 
 
 		 382 aa  225  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2834  ABC transporter related  47.22 
 
 		 358 aa  225  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.698538  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  45.94 
 
 		 334 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.56 
 
 		 386 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.56 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1017  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.23 
 
 		 388 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  49.62 
 
 		 353 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  42.46 
 
 		 331 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4770  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 		 395 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.95 
 
 		 377 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.28 
 
 		 380 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0661243  hitchhiker  0.000000930284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4133  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.46 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.52 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4466  ABC transporter-like  46.06 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.486534  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.16 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2170  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.07 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.051022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  41.98 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.9 
 
 		 423 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  51.65 
 
 		 345 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  43.46 
 
 		 350 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0082  ABC transporter related protein  37.03 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>