More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1292 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1292  ABC transporter related  100 
 
 		 268 aa  549  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.129998  normal  0.577563 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0985  ABC transporter related protein  73.05 
 
 		 259 aa  384  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3275  ABC transporter related  72.66 
 
 		 259 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0798  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  72.62 
 
 		 257 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  55.95 
 
 		 256 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  56.75 
 
 		 263 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  54.76 
 
 		 247 aa  279  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  53.97 
 
 		 246 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  54.37 
 
 		 254 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  53.78 
 
 		 256 aa  271  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  56.3 
 
 		 263 aa  271  8.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  53.78 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  53.12 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  51.49 
 
 		 267 aa  269  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  52.31 
 
 		 255 aa  265  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  51.78 
 
 		 254 aa  265  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  51.98 
 
 		 248 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  52.99 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  50 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.79 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.79 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  51.32 
 
 		 289 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  51.18 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  51.79 
 
 		 240 aa  263  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  51.79 
 
 		 240 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  50.37 
 
 		 252 aa  262  3e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 		 240 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  49.81 
 
 		 261 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  50.94 
 
 		 268 aa  262  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 		 240 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 		 240 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  51.79 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  51.31 
 
 		 289 aa  262  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  52.38 
 
 		 240 aa  261  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.39 
 
 		 240 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  52.8 
 
 		 254 aa  260  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  50.92 
 
 		 266 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  52.65 
 
 		 250 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  52.99 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  52.19 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  52.99 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.39 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  52.19 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  50.58 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  53.57 
 
 		 251 aa  259  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  50.92 
 
 		 266 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  53.57 
 
 		 248 aa  259  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  50.39 
 
 		 249 aa  258  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  54.44 
 
 		 244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  51.57 
 
 		 263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  51 
 
 		 240 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.98 
 
 		 254 aa  258  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  53.78 
 
 		 248 aa  258  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  51.57 
 
 		 288 aa  258  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  51.76 
 
 		 249 aa  258  8e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  53.36 
 
 		 247 aa  258  9e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  52 
 
 		 251 aa  258  9e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  50.39 
 
 		 262 aa  257  1e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 273 aa  257  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.6 
 
 		 595 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  50.79 
 
 		 246 aa  257  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  51.21 
 
 		 254 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  51.19 
 
 		 598 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  51.41 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  53.41 
 
 		 244 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  52.38 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  50.8 
 
 		 259 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  51.38 
 
 		 263 aa  255  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  54.62 
 
 		 243 aa  255  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  51.79 
 
 		 239 aa  255  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  52.53 
 
 		 247 aa  255  6e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  51.97 
 
 		 246 aa  255  6e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  54.2 
 
 		 256 aa  255  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  50.58 
 
 		 282 aa  254  9e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0210  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 248 aa  254  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.770881  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0257  ATP-binding protein  49.8 
 
 		 248 aa  254  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000197314 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  49.61 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  51 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  55.36 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  51.39 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  49.61 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  49.63 
 
 		 255 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  51 
 
 		 240 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  52.19 
 
 		 258 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  49.81 
 
 		 274 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  55.46 
 
 		 243 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52 
 
 		 592 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  50.6 
 
 		 243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  51.19 
 
 		 254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  50.99 
 
 		 251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  51.79 
 
 		 264 aa  252  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  49.8 
 
 		 256 aa  252  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  49.4 
 
 		 243 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  49.42 
 
 		 270 aa  252  5.000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  50.6 
 
 		 240 aa  252  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  50.58 
 
 		 249 aa  252  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>