More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2782 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2782  ABC transporter related  100 
 
 		 284 aa  556  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  61.97 
 
 		 212 aa  239  5e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0232  ATPase  52.04 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2629  ABC transporter-related protein  52.22 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1776  ABC transporter related  46.48 
 
 		 219 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.680063  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1648  ABC transporter related protein  48.98 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  44.39 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  37.39 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  42.52 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  36.45 
 
 		 244 aa  135  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  42.25 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  43.68 
 
 		 337 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  43.58 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  41.31 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0974  ABC transporter related  40.47 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0227339  unclonable  0.000000000000144331 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  38.07 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3967  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0069  ABC transporter related  42.16 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.675568 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0204  protein YabJ  37.56 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  41.78 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  36.49 
 
 		 226 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  36.41 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4742  cell division ATP-binding protein FtsE  35.58 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1829  ABC transporter related  40.47 
 
 		 328 aa  123  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.853496 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  37.44 
 
 		 810 aa  123  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0927  ABC-type transport system, ATPase component  37.5 
 
 		 216 aa  122  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  38.46 
 
 		 365 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  40.5 
 
 		 255 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.03 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1923  cell division ATP-binding protein FtsE  36.95 
 
 		 229 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000106993  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3452  ABC transporter related  38.32 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0285  ABC transporter related  39.07 
 
 		 334 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0897858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5610  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.74 
 
 		 360 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  35 
 
 		 225 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1676  ATP-binding component of a membrane-associated cell division complex FtsE  35.48 
 
 		 247 aa  118  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  35 
 
 		 225 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  33.78 
 
 		 226 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35 
 
 		 225 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35 
 
 		 225 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2055  ABC transporter related  39.34 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.351163  normal  0.0720953 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  35 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.7 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1929  ABC transporter related  37.78 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.82 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.55 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0630  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  34.21 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000125028  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  30.23 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  30.54 
 
 		 218 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0353  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  36.57 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00527297  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.42 
 
 		 355 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2412  cell division ATP-binding protein FtsE  36.41 
 
 		 230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1035  cell division ATP-binding protein FtsE  37.27 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  33.66 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3781  cell division ATP-binding protein FtsE  38.07 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0730  ABC transporter related  35.41 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1775  cell division ATP-binding protein FtsE  37.95 
 
 		 226 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.030617  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  31.53 
 
 		 226 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  37.5 
 
 		 229 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1366  putative putrescine transport ATP-binding protein  31.8 
 
 		 373 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  37.5 
 
 		 229 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.18 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2996  Sigma 54 interacting domain protein  36.87 
 
 		 223 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000178962 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3004  cell division ATP-binding protein FtsE  32.82 
 
 		 228 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000252068  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2478  cell division ATP-binding protein FtsE  34.86 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.831183  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1856  cell division ATP-binding protein FtsE  37.44 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663349  normal  0.473161 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.89 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  30.14 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  29.95 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0433  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  31.51 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  29.15 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.65 
 
 		 363 aa  113  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  30.41 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0754  ABC transporter related  35.71 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000176191  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  37.95 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1952  ABC transporter related  33.79 
 
 		 382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7227  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nopaline)  35.29 
 
 		 253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.589012  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1058  cell division ATP-binding protein FtsE  33.48 
 
 		 230 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1287  cell division ATP-binding protein FtsE  36.41 
 
 		 223 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0865  ABC transporter, ATP-binding protein  29.83 
 
 		 336 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5125  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  33.79 
 
 		 374 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0754257  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2071  ABC transporter related  39.15 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1046  cell division ATP-binding protein FtsE  31.51 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0412114  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1914  type II secretory pathway family protein  36.95 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0795  ABC transporter, ATP-binding protein  29.83 
 
 		 336 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.771589  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4448  type II secretory pathway family protein  36.95 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0982  cell division ATP-binding protein FtsE  35.91 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.356751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0793  cell division ATP-binding protein FtsE  36.45 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.475778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1860  cell division ATP-binding protein FtsE  34.56 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000300417  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.3 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2892  ABC transporter, ATP-binding protein  33.66 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.56 
 
 		 381 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.17 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  31.36 
 
 		 242 aa  112  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>