More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3573 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3500  ABC transporter related  100 
 
 		 348 aa  677    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3513  ABC transporter related  99.71 
 
 		 348 aa  674    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721065  normal  0.699541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3573  ABC transporter related  100 
 
 		 348 aa  677    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.736918  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3884  ABC transporter-related protein  81.76 
 
 		 351 aa  532  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.67 
 
 		 345 aa  256  5e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1233  methionine import ATP-binding protein MetN  38.3 
 
 		 340 aa  253  3e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0644  ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  55.6 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.19 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.19 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.19 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.19 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.19 
 
 		 343 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  55.19 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.19 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  55.19 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.19 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.19 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.19 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.19 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.19 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1908  ABC transporter-like protein  47.91 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.103908 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.94 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.7 
 
 		 344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.36 
 
 		 343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.77 
 
 		 343 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  50.59 
 
 		 352 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  50.59 
 
 		 352 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.53 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  53.53 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.77 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  53.11 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.38 
 
 		 343 aa  242  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.37 
 
 		 344 aa  242  7.999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.45 
 
 		 343 aa  241  9e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.45 
 
 		 343 aa  241  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  43.61 
 
 		 352 aa  241  9e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3248  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  45.62 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  53.11 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  41.89 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  52.87 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.25 
 
 		 344 aa  240  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  41.32 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  51.45 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0967  ABC transporter ATP-binding protein  46.91 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17000  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  47.76 
 
 		 323 aa  238  8e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.115214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  54.81 
 
 		 354 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  44.83 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03410  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  47.59 
 
 		 354 aa  236  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0805  ABC transporter related protein  51.41 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63859 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1075  methionine import ATP-binding protein MetN  47.37 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0646  ABC transporter related  56.07 
 
 		 333 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.7 
 
 		 344 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2760  ABC transporter related  44.08 
 
 		 359 aa  235  9e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0840965  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2742  ABC transporter related  45.28 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  39.05 
 
 		 339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1547  ABC transporter ATP-binding protein  45.28 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2661  ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  38.73 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.73 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.87 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0233022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3160  ABC transporter related protein  44.97 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0152583 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  38.73 
 
 		 339 aa  232  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.26 
 
 		 359 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3652  ABC transporter related  52.19 
 
 		 339 aa  232  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  50.62 
 
 		 345 aa  232  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  44.14 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23470  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  50.97 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00129815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0195  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0865  ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 		 336 aa  230  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  38.73 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  38.73 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1797  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.18 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  38.73 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  38.73 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  46.45 
 
 		 347 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.6 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.27 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0428  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  39.63 
 
 		 359 aa  230  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.982336  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.6 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.22 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.05 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.72 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2001  methionine transport ATP-binding protein  40.64 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.974934  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0795  ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.771589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  38.41 
 
 		 339 aa  229  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1796  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.18 
 
 		 341 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  38.41 
 
 		 339 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0931  ABC-type metal ion transport system ATPase component  48.4 
 
 		 332 aa  229  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03093  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.94 
 
 		 335 aa  229  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  38.73 
 
 		 339 aa  229  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.62 
 
 		 344 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 		 385 aa  229  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.87 
 
 		 344 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.28 
 
 		 344 aa  228  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1974  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.18 
 
 		 335 aa  228  8e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00627012  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.21 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  38.41 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.28 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.7 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>