More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0646 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0646  ABC transporter related  100 
 
 		 333 aa  640    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32450  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  54.46 
 
 		 335 aa  332  5e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.959297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0805  ABC transporter related protein  52.24 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63859 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1908  ABC transporter-like protein  48.59 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.103908 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  41.72 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2742  ABC transporter related  48.55 
 
 		 328 aa  271  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1547  ABC transporter ATP-binding protein  48.55 
 
 		 328 aa  271  9e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2661  ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 		 328 aa  271  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2760  ABC transporter related  45.92 
 
 		 359 aa  265  7e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0840965  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 352 aa  264  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 352 aa  263  3e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  40.18 
 
 		 352 aa  262  6.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3248  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  46.25 
 
 		 320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  44.81 
 
 		 351 aa  259  7e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.92 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  39.58 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  43.62 
 
 		 343 aa  255  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  43.62 
 
 		 343 aa  255  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.62 
 
 		 343 aa  255  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.62 
 
 		 343 aa  255  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  43.62 
 
 		 343 aa  255  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.62 
 
 		 343 aa  255  6e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.62 
 
 		 343 aa  255  6e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.62 
 
 		 343 aa  255  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0195  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 		 346 aa  255  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  46.33 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0160  ABC transporter related  41.03 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  42.43 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  40.06 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0176  ABC transporter ATP-binding protein  41.64 
 
 		 346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00383755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0174  ABC transporter ATP-binding protein  41.64 
 
 		 346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.157332  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  42.55 
 
 		 342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  39.69 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0166  ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 		 346 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.766032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  40.06 
 
 		 339 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  40.06 
 
 		 339 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  39.75 
 
 		 339 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  40.06 
 
 		 339 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3500  ABC transporter related  56.07 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3573  ABC transporter related  56.07 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.736918  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.67 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.67 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.67 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.67 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5127  ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  44.14 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0931  ABC-type metal ion transport system ATPase component  51.67 
 
 		 332 aa  250  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.67 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2336  ABC transporter-like  53.31 
 
 		 266 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.56 
 
 		 331 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0218  ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 346 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3513  ABC transporter related  55.65 
 
 		 348 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721065  normal  0.699541 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  40.68 
 
 		 342 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.63 
 
 		 345 aa  248  7e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.03 
 
 		 343 aa  248  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  39.43 
 
 		 339 aa  248  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0575  methionine import ATP-binding protein MetN 2  44.41 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0619  methionine import ATP-binding protein MetN 2  44.41 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0560  methionine import ATP-binding protein MetN 2  44.41 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0565  methionine import ATP-binding protein MetN 2  44.41 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0558  methionine import ATP-binding protein MetN 2  44.41 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0196  ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 346 aa  245  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000216687  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23470  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  46.05 
 
 		 349 aa  245  6.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00129815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  40.72 
 
 		 345 aa  245  6.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.33 
 
 		 343 aa  245  6.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  42.31 
 
 		 344 aa  245  8e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  43.67 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.22 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.31 
 
 		 344 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3884  ABC transporter-related protein  53.97 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2298  ABC transporter related  45.18 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.54 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03410  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  54.51 
 
 		 354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3531  ABC transporter related protein  36.94 
 
 		 341 aa  242  6e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.54 
 
 		 343 aa  242  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.81 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  38.97 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.47 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.87 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3652  ABC transporter related  52.17 
 
 		 339 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2630  ABC transporter related  52.89 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2398  ABC transporter related  44.85 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.38 
 
 		 344 aa  239  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  44.18 
 
 		 368 aa  239  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0973  ABC transporter related  41.46 
 
 		 338 aa  239  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.25 
 
 		 343 aa  238  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.25 
 
 		 343 aa  238  6.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.47 
 
 		 359 aa  238  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1681  ABC transporter related  44.82 
 
 		 338 aa  238  9e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000123006  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0250  ABC transporter related protein  44.31 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1342  ABC transporter related  52.08 
 
 		 263 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3160  ABC transporter related protein  54.96 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0152583 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  39.75 
 
 		 340 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1771  ABC transporter related  43 
 
 		 340 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237525  hitchhiker  0.000187341 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  41.52 
 
 		 341 aa  236  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>