More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03410 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_03410  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  100 
 
 
354 aa  692    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3160  ABC transporter related protein  67.87 
 
 
332 aa  322  9.000000000000001e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0152583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2760  ABC transporter related  52.88 
 
 
359 aa  295  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0840965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  58.44 
 
 
342 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  55.14 
 
 
342 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10510  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  50.88 
 
 
346 aa  273  5.000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0663634  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2661  ABC transporter, ATP-binding protein  46.11 
 
 
328 aa  271  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2742  ABC transporter related  46.11 
 
 
328 aa  271  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1547  ABC transporter ATP-binding protein  46.11 
 
 
328 aa  271  9e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1771  ABC transporter related  55.14 
 
 
340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237525  hitchhiker  0.000187341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1908  ABC transporter-like protein  49.84 
 
 
318 aa  269  7e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.103908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4491  ABC transporter related  47.04 
 
 
387 aa  268  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  45.59 
 
 
388 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0857  ABC transporter related protein  53.28 
 
 
338 aa  259  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  52.67 
 
 
341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.1 
 
 
369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  42.9 
 
 
344 aa  259  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  52.26 
 
 
341 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  44.48 
 
 
352 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1397  ABC transporter-related protein  53.91 
 
 
341 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  52.26 
 
 
397 aa  257  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  56.76 
 
 
352 aa  256  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  51.85 
 
 
341 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 
341 aa  256  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  51.85 
 
 
341 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 
341 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  51.85 
 
 
341 aa  256  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2912  ABC transporter ATP-binding protein  47.47 
 
 
366 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.44 
 
 
344 aa  255  9e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 
341 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  56.31 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.26 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.68 
 
 
355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 
341 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.46 
 
 
343 aa  253  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  44.82 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0805  ABC transporter related protein  49.65 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.63859 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  43.62 
 
 
350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  52.67 
 
 
351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.47 
 
 
368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 
341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  51.44 
 
 
343 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.5 
 
 
348 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.5 
 
 
348 aa  252  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  45.85 
 
 
394 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  45.85 
 
 
394 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  41.4 
 
 
347 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.85 
 
 
343 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17000  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  49.35 
 
 
323 aa  251  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.115214  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.58 
 
 
382 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  45.85 
 
 
392 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  43.3 
 
 
397 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.03 
 
 
343 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.03 
 
 
343 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  43.3 
 
 
354 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.03 
 
 
343 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.03 
 
 
343 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3248  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  43.88 
 
 
320 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0270  ABC transporter related protein  57.72 
 
 
374 aa  250  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.920822  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0311  ABC metal ion transporter, ATPase subunit  46.25 
 
 
398 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  42.34 
 
 
340 aa  250  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  51.03 
 
 
343 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  51.03 
 
 
343 aa  249  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.03 
 
 
343 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  51.03 
 
 
343 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.03 
 
 
343 aa  249  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.03 
 
 
343 aa  249  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.03 
 
 
343 aa  249  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.03 
 
 
343 aa  249  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.03 
 
 
343 aa  249  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  42.63 
 
 
340 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.03 
 
 
343 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  56.31 
 
 
337 aa  248  9e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.44 
 
 
343 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.44 
 
 
343 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23470  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  56.17 
 
 
349 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00129815  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.07 
 
 
385 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2536  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.73 
 
 
352 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0300192  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.74 
 
 
377 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1439  ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
361 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  50.62 
 
 
343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.69 
 
 
356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  51.03 
 
 
345 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0546  methionine ABC transporter ATP-binding protein  54.66 
 
 
405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2812  ABC transporter related protein  50.66 
 
 
344 aa  245  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3160  ABC transporter related  46.15 
 
 
337 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.03 
 
 
343 aa  245  8e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1867  ABC transporter, ATP-binding protein  56.33 
 
 
380 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0621935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2301  ABC transporter related  44.17 
 
 
392 aa  245  8e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.03 
 
 
343 aa  245  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0858  methionine ABC transporter ATP-binding protein  56.33 
 
 
404 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2174  methionine ABC transporter ATP-binding protein  56.33 
 
 
404 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0448  methionine ABC transporter ATP-binding protein  56.33 
 
 
404 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0558  methionine import ATP-binding protein MetN 2  43.73 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0235  ABC transporter related  45.34 
 
 
369 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0575  methionine import ATP-binding protein MetN 2  43.73 
 
 
338 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3393  ABC transporter related  54.24 
 
 
391 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0565  methionine import ATP-binding protein MetN 2  43.73 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0619  methionine import ATP-binding protein MetN 2  51.53 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0560  methionine import ATP-binding protein MetN 2  43.73 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>