More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2760 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  78.31 
 
 
249 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  79.84 
 
 
252 aa  407  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  76.21 
 
 
249 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  75 
 
 
249 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  69.2 
 
 
266 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  67.2 
 
 
255 aa  338  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  65.6 
 
 
254 aa  337  8e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  60.64 
 
 
254 aa  323  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  58.33 
 
 
256 aa  276  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1807  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  59.44 
 
 
256 aa  267  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000072763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  53.31 
 
 
257 aa  265  8e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  52.89 
 
 
253 aa  260  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  53.65 
 
 
243 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  55.84 
 
 
271 aa  257  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  52.67 
 
 
244 aa  254  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  52.19 
 
 
270 aa  254  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  52.7 
 
 
252 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.6 
 
 
255 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  50 
 
 
255 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  49.6 
 
 
255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.9 
 
 
259 aa  244  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  52.14 
 
 
242 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  49.38 
 
 
270 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50.64 
 
 
259 aa  241  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  49.16 
 
 
250 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
258 aa  238  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  49.58 
 
 
264 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  51.07 
 
 
246 aa  237  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.7 
 
 
278 aa  236  3e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  51.8 
 
 
247 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  51.8 
 
 
247 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.48 
 
 
246 aa  234  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  52.53 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.92 
 
 
277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50.64 
 
 
256 aa  233  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  48.32 
 
 
239 aa  230  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  47.9 
 
 
240 aa  229  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.03 
 
 
281 aa  228  6e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.61 
 
 
278 aa  226  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.61 
 
 
281 aa  225  6e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  53.05 
 
 
252 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.19 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  42.39 
 
 
453 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0692  ABC transporter related  47.74 
 
 
244 aa  219  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  44.03 
 
 
398 aa  219  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  45 
 
 
277 aa  219  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.35 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.27 
 
 
402 aa  210  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  43.1 
 
 
239 aa  209  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  40 
 
 
283 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.03 
 
 
403 aa  206  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  42.62 
 
 
380 aa  205  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.8 
 
 
273 aa  204  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  42.19 
 
 
263 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.33 
 
 
440 aa  204  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.08 
 
 
288 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.21 
 
 
283 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.8 
 
 
276 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.61 
 
 
281 aa  202  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.44 
 
 
541 aa  202  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.5 
 
 
310 aa  201  8e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.74 
 
 
411 aa  201  8e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.39 
 
 
286 aa  199  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1759  ABC transporter related  42.86 
 
 
291 aa  199  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.807562  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  43.46 
 
 
568 aa  199  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.33 
 
 
456 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.39 
 
 
285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.39 
 
 
285 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.57 
 
 
395 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.23 
 
 
403 aa  193  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  41.67 
 
 
280 aa  191  8e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  43.09 
 
 
290 aa  191  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  37.4 
 
 
287 aa  190  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.54 
 
 
270 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  39.66 
 
 
282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12570  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  42.11 
 
 
344 aa  187  9e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  40.61 
 
 
283 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  40.61 
 
 
283 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  42.02 
 
 
242 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  43.21 
 
 
288 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  39.67 
 
 
568 aa  186  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  40 
 
 
285 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  40.42 
 
 
284 aa  185  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  39.66 
 
 
571 aa  185  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2132  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.83 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  37.55 
 
 
574 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 
276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.51 
 
 
284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  43.69 
 
 
277 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2734  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.62 
 
 
285 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.67 
 
 
281 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.18 
 
 
280 aa  180  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0319  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.96 
 
 
288 aa  179  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.2074000000000003e-19 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39 
 
 
281 aa  179  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  37.76 
 
 
593 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.18 
 
 
276 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 
279 aa  178  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0829  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.27 
 
 
292 aa  178  8e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.773526  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  38.52 
 
 
274 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.196355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>