More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9351 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9351  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 		 247 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3555  ABC transporter-like protein  78.14 
 
 		 247 aa  394  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.836989  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6886  ABC transporter related  66.53 
 
 		 254 aa  329  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  62.75 
 
 		 247 aa  310  9e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  61.13 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4573  ABC transporter related  63.9 
 
 		 245 aa  301  8.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.958024  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3100  ABC transporter related protein  63.27 
 
 		 251 aa  299  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2777  ABC transporter related  60.33 
 
 		 252 aa  295  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59.67 
 
 		 246 aa  292  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  57.89 
 
 		 247 aa  288  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7639  ABC transporter related protein  58.78 
 
 		 249 aa  284  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.2 
 
 		 242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  52.92 
 
 		 240 aa  278  6e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  53.33 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  56.43 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  54.36 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  52.92 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  52.92 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.6 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  54.17 
 
 		 244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  54.17 
 
 		 242 aa  272  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  56.25 
 
 		 257 aa  272  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 253 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0877  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.7 
 
 		 261 aa  271  5.000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00896077  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  52.89 
 
 		 246 aa  271  7e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  50 
 
 		 240 aa  271  8.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  52.92 
 
 		 240 aa  271  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  52.92 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  54.36 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  53.75 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  55.56 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.3 
 
 		 267 aa  268  4e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.08 
 
 		 240 aa  269  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 		 240 aa  269  4e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  52.92 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  52.08 
 
 		 246 aa  268  7e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 		 240 aa  268  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  52.92 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  54.43 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.02 
 
 		 273 aa  266  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  55.02 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  52.5 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  53.85 
 
 		 252 aa  265  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  52.08 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.11 
 
 		 244 aa  265  4e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  52.5 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.32 
 
 		 278 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  54.15 
 
 		 273 aa  265  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  53.33 
 
 		 244 aa  265  5e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  52.74 
 
 		 257 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  55.08 
 
 		 256 aa  265  5.999999999999999e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  53.11 
 
 		 249 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  52.07 
 
 		 244 aa  265  7e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  50.83 
 
 		 240 aa  265  7e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  55.79 
 
 		 244 aa  264  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  53.72 
 
 		 242 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.45 
 
 		 246 aa  264  8.999999999999999e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  54.58 
 
 		 269 aa  264  8.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  53.75 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  54.17 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.83 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1234  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.08 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  51.25 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  55.46 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.25 
 
 		 240 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.25 
 
 		 240 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.25 
 
 		 240 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.25 
 
 		 240 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  56.1 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  52.92 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.25 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  54.66 
 
 		 252 aa  262  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  52.08 
 
 		 241 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.83 
 
 		 244 aa  261  6e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  52.28 
 
 		 244 aa  261  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 242 aa  261  8.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  53.47 
 
 		 266 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  54.62 
 
 		 262 aa  260  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  53.75 
 
 		 243 aa  260  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  51.43 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  49.79 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.91 
 
 		 244 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  52.08 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  53.33 
 
 		 243 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  56.43 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.83 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  51.67 
 
 		 241 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  51.67 
 
 		 241 aa  259  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  52.28 
 
 		 243 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  54.39 
 
 		 243 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  53.39 
 
 		 249 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  51.67 
 
 		 241 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  51.67 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.25 
 
 		 241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  53.11 
 
 		 243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  51.67 
 
 		 241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  51.25 
 
 		 241 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  51.25 
 
 		 241 aa  258  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  51.67 
 
 		 241 aa  258  8e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>