More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2777 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2777  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3555  ABC transporter-like protein  61.57 
 
 		 247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.836989  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9351  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  60.33 
 
 		 247 aa  295  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6886  ABC transporter related  61.89 
 
 		 254 aa  285  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4573  ABC transporter related  58.68 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.958024  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0877  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.52 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00896077  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  53.53 
 
 		 247 aa  272  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  53.94 
 
 		 247 aa  271  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  53.53 
 
 		 247 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  56.25 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 257 aa  262  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.1 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3100  ABC transporter related protein  56.97 
 
 		 251 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  51.88 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.32 
 
 		 273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  47.52 
 
 		 243 aa  252  3e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3307  ABC transporter related  52.08 
 
 		 259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  47.56 
 
 		 247 aa  252  5.000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  51.87 
 
 		 244 aa  252  5.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  50.62 
 
 		 244 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  51.9 
 
 		 241 aa  251  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  53.36 
 
 		 258 aa  251  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  47.52 
 
 		 243 aa  250  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  47.11 
 
 		 243 aa  250  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  48.59 
 
 		 260 aa  249  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4158  ABC transporter related  51.39 
 
 		 254 aa  249  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  52.28 
 
 		 249 aa  249  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  51.65 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  53.33 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  50.83 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  48.55 
 
 		 242 aa  248  5e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  51.2 
 
 		 244 aa  248  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1514  ABC transporter ATP-binding protein  49.17 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  50.83 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  53.91 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.21 
 
 		 258 aa  246  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  50.41 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7639  ABC transporter related protein  51.24 
 
 		 249 aa  245  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  49.61 
 
 		 259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  54.36 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  51.04 
 
 		 260 aa  245  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  48.75 
 
 		 252 aa  245  6e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 240 aa  245  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  51.04 
 
 		 244 aa  244  6.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  52.16 
 
 		 266 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  52.38 
 
 		 271 aa  244  8e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  51.43 
 
 		 260 aa  244  8e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  49.18 
 
 		 245 aa  244  9e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  52.68 
 
 		 243 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  49.17 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  50 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  50.59 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  48.3 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.97 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  48.8 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  48.85 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  51.78 
 
 		 266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  49.38 
 
 		 265 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  45.04 
 
 		 242 aa  242  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 240 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 		 244 aa  243  3e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2630  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.48 
 
 		 278 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00585721  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  47.5 
 
 		 246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  50 
 
 		 240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47960  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.17 
 
 		 240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0293846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  48.77 
 
 		 245 aa  242  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1133  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.29 
 
 		 278 aa  241  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.772292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 240 aa  241  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  50.6 
 
 		 252 aa  241  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  49.18 
 
 		 253 aa  241  7e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  48.19 
 
 		 255 aa  241  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  50.64 
 
 		 246 aa  241  7.999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  48.75 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.33 
 
 		 244 aa  241  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 249 aa  240  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  51.25 
 
 		 247 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  46.69 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1806  ABC transporter related  51.04 
 
 		 248 aa  241  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  49.59 
 
 		 242 aa  241  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  47.92 
 
 		 241 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  46.25 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  51.5 
 
 		 262 aa  239  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  47.92 
 
 		 241 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  48.13 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  47.92 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.2 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  50.21 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  47.92 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  47.52 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  47.52 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  47.6 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.52 
 
 		 241 aa  238  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  49.17 
 
 		 242 aa  238  5e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  48.75 
 
 		 240 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  48.61 
 
 		 254 aa  238  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  52.63 
 
 		 254 aa  238  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  46.94 
 
 		 246 aa  238  5.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  44.35 
 
 		 360 aa  238  5.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.54 
 
 		 267 aa  238  5.999999999999999e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>