More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4573 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4573  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  491  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.958024  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3555  ABC transporter-like protein  65.98 
 
 		 247 aa  322  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.836989  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9351  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  63.9 
 
 		 247 aa  315  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6886  ABC transporter related  65 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  59.75 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2777  ABC transporter related  58.68 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  57.68 
 
 		 247 aa  286  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  56.43 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  56.25 
 
 		 245 aa  275  4e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  54.39 
 
 		 257 aa  275  7e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  53.33 
 
 		 243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  53.97 
 
 		 257 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  50 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  55.98 
 
 		 250 aa  271  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7639  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 249 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  55.19 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3100  ABC transporter related protein  60.16 
 
 		 251 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 257 aa  270  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  52.5 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  52.5 
 
 		 243 aa  269  4e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  54.77 
 
 		 245 aa  269  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  52.67 
 
 		 244 aa  268  7e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.7 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  53.11 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 		 273 aa  265  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  53.09 
 
 		 243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  53.33 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  54.77 
 
 		 249 aa  264  8e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  53.75 
 
 		 244 aa  264  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  56.07 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  53.11 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  51.85 
 
 		 243 aa  262  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1533  ABC transporter related  51.03 
 
 		 246 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  51.28 
 
 		 242 aa  261  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  51.46 
 
 		 247 aa  261  8e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.33 
 
 		 244 aa  261  8.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  53.85 
 
 		 249 aa  261  8.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.25 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  52.08 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  52.08 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  54.17 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  51.25 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4140  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.44 
 
 		 254 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  52.07 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  54.43 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  49.58 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  52.3 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  54.02 
 
 		 243 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  50.42 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  52.3 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  50.43 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  49.17 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  52.28 
 
 		 242 aa  258  4e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  55 
 
 		 244 aa  258  6e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  50.83 
 
 		 240 aa  258  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  52.46 
 
 		 260 aa  258  7e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  52.32 
 
 		 249 aa  258  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  51.25 
 
 		 240 aa  258  7e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3878  ABC transporter  53.04 
 
 		 254 aa  257  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999854  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  52.5 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  53.33 
 
 		 265 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  53.33 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  51.04 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  53.69 
 
 		 262 aa  257  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  52.92 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  52.5 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  52.28 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  52.05 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  50.42 
 
 		 241 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  50.83 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  51.05 
 
 		 246 aa  255  4e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  51.64 
 
 		 244 aa  255  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  51.87 
 
 		 242 aa  255  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  50.42 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  52.48 
 
 		 269 aa  255  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  50.83 
 
 		 246 aa  255  6e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  52.8 
 
 		 245 aa  254  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  52.08 
 
 		 255 aa  254  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  51.25 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  50.42 
 
 		 241 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  50.21 
 
 		 363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  50.21 
 
 		 363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  50.42 
 
 		 241 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3307  ABC transporter related  52.5 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  48.95 
 
 		 363 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  52.12 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  51.28 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  51.25 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  56.67 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.25 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.46 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  51.67 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.25 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  50.63 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  50 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  47.7 
 
 		 360 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>