More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1657 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1657  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
264 aa  549  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0792  phosphate ABC transporter permease  75.79 
 
 
259 aa  418  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000617004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3565  phosphate ABC transporter permease  74.9 
 
 
259 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1096  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  73.91 
 
 
259 aa  411  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.53322  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0381  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  73.71 
 
 
260 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0977682  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1088  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  77.2 
 
 
269 aa  401  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1050  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  71.2 
 
 
265 aa  380  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  hitchhiker  0.000000448659 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1021  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  70.8 
 
 
265 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3953  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.62 
 
 
279 aa  361  7.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179007  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0744  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.29 
 
 
254 aa  344  7e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121752  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1139  phosphate transport system permease protein 1  64.23 
 
 
260 aa  338  4e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2660  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.3 
 
 
253 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2267  phosphate transporter ATP-binding protein  62.02 
 
 
303 aa  335  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.75 
 
 
253 aa  336  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1929  phosphate transporter ATP-binding protein  62.02 
 
 
305 aa  334  9e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0381146  normal  0.0357892 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  62.99 
 
 
253 aa  333  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0658  phosphate transporter ATP-binding protein  60.23 
 
 
260 aa  333  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1599  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.87 
 
 
278 aa  333  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.56 
 
 
276 aa  332  5e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3411  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.45 
 
 
258 aa  331  6e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2222  phosphate transporter ATP-binding protein  61.24 
 
 
264 aa  331  7.000000000000001e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1616  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.7 
 
 
260 aa  331  9e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000191963  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  64.11 
 
 
285 aa  330  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  62.55 
 
 
251 aa  330  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  60.56 
 
 
252 aa  329  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  60.78 
 
 
255 aa  328  4e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 
277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2811  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.4 
 
 
261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4915  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.47 
 
 
260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  normal  0.341234 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  61.2 
 
 
256 aa  325  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0577  phosphate transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
282 aa  325  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618048  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0783  phosphate transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
280 aa  325  5e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431594  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1621  phosphate transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
282 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2770  phosphate transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
282 aa  325  5e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13521  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1488  phosphate transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
282 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1518  phosphate transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
282 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1294  phosphate transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
282 aa  325  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0574  phosphate transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
282 aa  325  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1487  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.71 
 
 
293 aa  324  7e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0256969  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4414  phosphate transporter ATP-binding protein  61.63 
 
 
276 aa  324  7e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2314  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.2 
 
 
259 aa  324  9e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2255  phosphate transporter ATP-binding protein  58.94 
 
 
263 aa  324  9e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  61.02 
 
 
277 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2396  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  61.26 
 
 
283 aa  323  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0638  phosphate transporter ATP-binding protein  59.61 
 
 
272 aa  323  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  61.02 
 
 
277 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2203  phosphate transporter ATP-binding protein  59.46 
 
 
260 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574176  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2164  phosphate transporter ATP-binding protein  58.71 
 
 
262 aa  322  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13557  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0350  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.36 
 
 
251 aa  322  5e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000161831 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0539  phosphate ABC transporter permease  61.38 
 
 
272 aa  322  5e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.96 
 
 
254 aa  321  8e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1989  phosphate transporter ATP-binding protein  59.07 
 
 
266 aa  321  9.000000000000001e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1715  phosphate transporter ATP-binding protein  58.71 
 
 
263 aa  321  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.141839  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1532  phosphate transporter ATP-binding protein  60.4 
 
 
263 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0836  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.2 
 
 
260 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00992429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2629  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.45 
 
 
260 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.10241 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 
261 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2023  phosphate transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 
263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157085  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2182  phosphate transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 
262 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.508405  normal  0.137715 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3160  phosphate transporter ATP-binding protein  60.98 
 
 
258 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0486  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.17 
 
 
251 aa  319  3e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4446  phosphate transporter ATP-binding protein  60.7 
 
 
282 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  60.71 
 
 
277 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 
253 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4920  phosphate transporter ATP-binding protein  60 
 
 
275 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.506329 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1794  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.2 
 
 
295 aa  318  3.9999999999999996e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0186801  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2017  phosphate transporter ATP-binding protein  60.7 
 
 
282 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0509  phosphate transporter ATP-binding protein  58.4 
 
 
273 aa  318  5e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518327 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1489  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60 
 
 
260 aa  318  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2369  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60 
 
 
260 aa  318  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5326  phosphate transporter ATP-binding protein  60.32 
 
 
281 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  60.89 
 
 
272 aa  318  6e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004378  phosphate transport ATP-binding protein PstB  60.98 
 
 
272 aa  318  7e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01033  phosphate transporter ATP-binding protein  60.98 
 
 
272 aa  318  7e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  57.77 
 
 
251 aa  318  7e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  60.4 
 
 
262 aa  318  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  60.32 
 
 
277 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  60 
 
 
249 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1290  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.48 
 
 
261 aa  317  9e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1192  phosphate transporter ATP-binding protein  60.31 
 
 
282 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270941  normal  0.470836 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  59.92 
 
 
285 aa  317  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1180  phosphate transporter ATP-binding protein  60.31 
 
 
282 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 
284 aa  317  1e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5038  phosphate transporter ATP-binding protein  59.92 
 
 
277 aa  316  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268746  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5612  phosphate transporter ATP-binding protein  59.92 
 
 
277 aa  316  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8399  normal  0.188753 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.73 
 
 
251 aa  317  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0580  phosphate ABC transporter permease  58.4 
 
 
259 aa  317  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0822  phosphate transporter ATP-binding protein  60.7 
 
 
282 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3821  ABC-type phosphate transporter, ATP-binding protein  59.36 
 
 
249 aa  316  2e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1303  phosphate transporter ATP-binding protein  60.7 
 
 
282 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348683  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1274  phosphate transporter ATP-binding protein  60.7 
 
 
282 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  60.4 
 
 
262 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  59.92 
 
 
277 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  60.4 
 
 
262 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7425  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.42 
 
 
270 aa  316  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  58.53 
 
 
272 aa  315  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  58.53 
 
 
272 aa  315  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0622  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.16 
 
 
269 aa  316  3e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.970932  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  58.53 
 
 
272 aa  315  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2521  phosphate ABC transporter ATPase subunit  59.77 
 
 
273 aa  315  4e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0748442  normal  0.186434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>