More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0539 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0539  phosphate ABC transporter permease  100 
 
 		 272 aa  570  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  74.62 
 
 		 277 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  74.62 
 
 		 277 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  72.73 
 
 		 277 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5038  phosphate transporter ATP-binding protein  71.22 
 
 		 277 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268746  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5612  phosphate transporter ATP-binding protein  71.64 
 
 		 277 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8399  normal  0.188753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  72.73 
 
 		 277 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5326  phosphate transporter ATP-binding protein  71.59 
 
 		 281 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4414  phosphate transporter ATP-binding protein  70.83 
 
 		 276 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  71.59 
 
 		 277 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  72.35 
 
 		 277 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  72.05 
 
 		 272 aa  403  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  71.97 
 
 		 277 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  72.69 
 
 		 285 aa  401  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1568  phosphate transporter ATP-binding protein  71.65 
 
 		 272 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.120557  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  71.65 
 
 		 272 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  69.58 
 
 		 272 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  71.65 
 
 		 272 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2816  phosphate transporter ATP-binding protein  71.65 
 
 		 272 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1725  phosphate transporter ATP-binding protein  71.26 
 
 		 264 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  69.85 
 
 		 276 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3166  phosphate transporter ATP-binding protein  70.47 
 
 		 272 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1436  phosphate transporter ATP-binding protein  71.26 
 
 		 272 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  71.26 
 
 		 272 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  71.26 
 
 		 272 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  70.47 
 
 		 272 aa  396  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2743  phosphate transporter ATP-binding protein  70.87 
 
 		 272 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  71.26 
 
 		 272 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1410  phosphate transporter ATP-binding protein  70.87 
 
 		 272 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.261593  normal  0.0224304 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004378  phosphate transport ATP-binding protein PstB  71.26 
 
 		 272 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  70.08 
 
 		 272 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01033  phosphate transporter ATP-binding protein  71.26 
 
 		 272 aa  390  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3538  phosphate transporter ATP-binding protein  69.29 
 
 		 270 aa  388  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.484334  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3640  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  69.7 
 
 		 279 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.720751  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2396  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  68.94 
 
 		 283 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0260  phosphate transporter ATP-binding protein  69.29 
 
 		 273 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47384  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  69.08 
 
 		 285 aa  377  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1347  phosphate transporter ATP-binding protein  69.69 
 
 		 270 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1230  phosphate transporter ATP-binding protein  69.69 
 
 		 270 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1239  phosphate transporter ATP-binding protein  69.29 
 
 		 271 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3116  phosphate transporter ATP-binding protein  69.69 
 
 		 262 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2942  phosphate transporter ATP-binding protein  65.44 
 
 		 271 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1336  phosphate transporter ATP-binding protein  64.71 
 
 		 271 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  69.55 
 
 		 284 aa  371  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5484  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  70.08 
 
 		 277 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2452  phosphate transporter ATP-binding protein  67.72 
 
 		 272 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  67.59 
 
 		 261 aa  363  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2669  phosphate transporter ATP-binding protein  66.93 
 
 		 271 aa  363  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3160  phosphate transporter ATP-binding protein  66.12 
 
 		 258 aa  361  9e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  66.27 
 
 		 251 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.08 
 
 		 253 aa  355  5e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0658  phosphate transporter ATP-binding protein  66.4 
 
 		 260 aa  354  7.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  66.8 
 
 		 252 aa  353  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  64.75 
 
 		 251 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  65.86 
 
 		 253 aa  350  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03149  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  64.57 
 
 		 268 aa  350  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985178  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0744  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.61 
 
 		 254 aa  348  4e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121752  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  64.43 
 
 		 255 aa  348  5e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64 
 
 		 251 aa  345  4e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0350  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.52 
 
 		 251 aa  344  8.999999999999999e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000161831 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1929  phosphate transporter ATP-binding protein  65.99 
 
 		 305 aa  343  1e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0381146  normal  0.0357892 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.75 
 
 		 255 aa  343  2e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  63.1 
 
 		 256 aa  343  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1919  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.1 
 
 		 253 aa  342  2.9999999999999997e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.603751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1156  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.64 
 
 		 255 aa  342  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3265  phosphate ABC transporter permease  63.39 
 
 		 257 aa  342  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1439  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  63.64 
 
 		 255 aa  342  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.16 
 
 		 252 aa  342  5e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  62.8 
 
 		 252 aa  342  5e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3638  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.35 
 
 		 267 aa  340  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000916154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1376  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60 
 
 		 260 aa  340  1e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.6 
 
 		 258 aa  338  4e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0291  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  56.62 
 
 		 267 aa  338  5e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000180282  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.32 
 
 		 252 aa  338  5.9999999999999996e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.71 
 
 		 253 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1616  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.55 
 
 		 260 aa  338  7e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000191963  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0486  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.89 
 
 		 251 aa  337  8e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  64.61 
 
 		 251 aa  337  9e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.61 
 
 		 273 aa  337  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2548  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.11 
 
 		 292 aa  337  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.3 
 
 		 251 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  62.3 
 
 		 260 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  64.78 
 
 		 249 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1489  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62 
 
 		 260 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4148  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.63 
 
 		 286 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.16 
 
 		 251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  61.42 
 
 		 253 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0607  phosphate transporter ATP-binding protein  61.42 
 
 		 253 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.080383  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2660  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.3 
 
 		 253 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28110  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.1 
 
 		 250 aa  336  1.9999999999999998e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2369  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62 
 
 		 260 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1794  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.67 
 
 		 295 aa  335  3.9999999999999995e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0186801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.35 
 
 		 251 aa  335  5e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.16 
 
 		 249 aa  335  5e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0622  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.89 
 
 		 269 aa  335  5e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.970932  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1790  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.11 
 
 		 297 aa  334  7e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530432  decreased coverage  0.00975681 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2278  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.04 
 
 		 253 aa  334  9e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4402  phosphate transporter ATP-binding protein  63.93 
 
 		 271 aa  333  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1479  phosphate ABC transporter permease  62.3 
 
 		 260 aa  333  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2222  phosphate transporter ATP-binding protein  65.31 
 
 		 264 aa  334  1e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.150141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>