More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5373 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5326  phosphate transporter ATP-binding protein  99.28 
 
 		 281 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 277 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  99.28 
 
 		 277 aa  573  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  97.83 
 
 		 277 aa  567  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5612  phosphate transporter ATP-binding protein  95.31 
 
 		 277 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8399  normal  0.188753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5038  phosphate transporter ATP-binding protein  91.7 
 
 		 277 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268746  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  90.61 
 
 		 277 aa  532  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  88.45 
 
 		 277 aa  515  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  88.81 
 
 		 277 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  88.81 
 
 		 277 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5484  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  91.7 
 
 		 277 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4414  phosphate transporter ATP-binding protein  78.47 
 
 		 276 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  73.29 
 
 		 285 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  70.44 
 
 		 276 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  73.7 
 
 		 272 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3166  phosphate transporter ATP-binding protein  73.33 
 
 		 272 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  73.7 
 
 		 272 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  72.96 
 
 		 272 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  72.96 
 
 		 272 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  72.96 
 
 		 272 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1436  phosphate transporter ATP-binding protein  72.96 
 
 		 272 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  71.01 
 
 		 285 aa  410  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3640  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  75.2 
 
 		 279 aa  408  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.720751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1725  phosphate transporter ATP-binding protein  75.59 
 
 		 264 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2396  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  68.9 
 
 		 283 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2816  phosphate transporter ATP-binding protein  71.85 
 
 		 272 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1568  phosphate transporter ATP-binding protein  71.85 
 
 		 272 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.120557  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  71.85 
 
 		 272 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  75.2 
 
 		 272 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004378  phosphate transport ATP-binding protein PstB  74.02 
 
 		 272 aa  407  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  72.59 
 
 		 272 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  71.85 
 
 		 272 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1410  phosphate transporter ATP-binding protein  76.28 
 
 		 272 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.261593  normal  0.0224304 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2743  phosphate transporter ATP-binding protein  72.22 
 
 		 272 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01033  phosphate transporter ATP-binding protein  73.62 
 
 		 272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2452  phosphate transporter ATP-binding protein  74.41 
 
 		 272 aa  404  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0539  phosphate ABC transporter permease  71.97 
 
 		 272 aa  403  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0260  phosphate transporter ATP-binding protein  72.83 
 
 		 273 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47384  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  67.88 
 
 		 284 aa  395  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1239  phosphate transporter ATP-binding protein  70.2 
 
 		 271 aa  384  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3538  phosphate transporter ATP-binding protein  70.47 
 
 		 270 aa  381  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.484334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1230  phosphate transporter ATP-binding protein  70.87 
 
 		 270 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1347  phosphate transporter ATP-binding protein  70.87 
 
 		 270 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3116  phosphate transporter ATP-binding protein  70.87 
 
 		 262 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  68.22 
 
 		 261 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2669  phosphate transporter ATP-binding protein  67.45 
 
 		 271 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0658  phosphate transporter ATP-binding protein  67.44 
 
 		 260 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1336  phosphate transporter ATP-binding protein  68.63 
 
 		 271 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2942  phosphate transporter ATP-binding protein  69.02 
 
 		 271 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3160  phosphate transporter ATP-binding protein  67.61 
 
 		 258 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  70.37 
 
 		 253 aa  362  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2548  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  67.74 
 
 		 292 aa  361  9e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  65.74 
 
 		 253 aa  360  2e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  67.47 
 
 		 253 aa  356  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3265  phosphate ABC transporter permease  67.32 
 
 		 257 aa  355  3.9999999999999996e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03149  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  65.75 
 
 		 268 aa  352  2.9999999999999997e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  67.6 
 
 		 251 aa  352  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  67.9 
 
 		 256 aa  351  8e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  68.6 
 
 		 251 aa  350  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  66.53 
 
 		 255 aa  349  3e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2278  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  64.4 
 
 		 253 aa  348  4e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  67.77 
 
 		 252 aa  348  7e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  66.27 
 
 		 252 aa  347  9e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2660  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.94 
 
 		 253 aa  347  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 		 251 aa  347  2e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  66.8 
 
 		 251 aa  345  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  66.4 
 
 		 249 aa  345  5e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  64.8 
 
 		 260 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  64.78 
 
 		 262 aa  343  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0171  phosphate transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 271 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0181  phosphate transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 271 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3118  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  67.49 
 
 		 291 aa  342  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0430987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  64.78 
 
 		 262 aa  342  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 		 251 aa  342  5e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1303  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.64 
 
 		 259 aa  341  5.999999999999999e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.673171 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  66.26 
 
 		 275 aa  341  7e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1139  phosphate transport system permease protein 1  64.11 
 
 		 260 aa  341  8e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  65.59 
 
 		 251 aa  341  8e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  64.78 
 
 		 262 aa  341  9e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1919  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.95 
 
 		 253 aa  340  1e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.603751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.59 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  65.99 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0350  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.45 
 
 		 251 aa  340  1e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000161831 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  64.37 
 
 		 258 aa  340  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0486  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.65 
 
 		 251 aa  340  2e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1307  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.45 
 
 		 260 aa  339  2e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.390273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3821  ABC-type phosphate transporter, ATP-binding protein  63.97 
 
 		 249 aa  340  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3638  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.39 
 
 		 267 aa  340  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000916154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2267  phosphate transporter ATP-binding protein  66.4 
 
 		 303 aa  340  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.45 
 
 		 273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0291  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62 
 
 		 267 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000180282  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1599  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.52 
 
 		 278 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64 
 
 		 251 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4148  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.36 
 
 		 286 aa  338  4e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1794  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.26 
 
 		 295 aa  338  7e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0186801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.29 
 
 		 252 aa  338  8e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4063  phosphate transporter ATP-binding protein  61.28 
 
 		 269 aa  337  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4079  phosphate transporter ATP-binding protein  61.28 
 
 		 269 aa  337  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4185  phosphate transporter ATP-binding protein  61.28 
 
 		 269 aa  337  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4135  phosphate transporter ATP-binding protein  61.28 
 
 		 269 aa  337  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0659059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>