33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1118 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  823    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1940  hypothetical protein  90.21 
 
 
419 aa  748    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34914  hitchhiker  0.0000000111377 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  25.51 
 
 
457 aa  64.7  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  25.48 
 
 
461 aa  63.9  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  31.21 
 
 
513 aa  60.1  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2348  hypothetical protein  31.25 
 
 
461 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  38.38 
 
 
386 aa  53.9  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  35.29 
 
 
412 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  40.96 
 
 
459 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1441  hypothetical protein  23.5 
 
 
307 aa  50.4  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0532167  hitchhiker  0.00000885873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  27.94 
 
 
448 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  27.94 
 
 
448 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  28.77 
 
 
478 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  28.77 
 
 
459 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  30.77 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  34.07 
 
 
394 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  31.96 
 
 
395 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  30.1 
 
 
571 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  29.21 
 
 
435 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  34.09 
 
 
460 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  33.98 
 
 
429 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0471  hypothetical protein  35.04 
 
 
533 aa  46.2  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0692558  decreased coverage  0.00000000612882 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  23.6 
 
 
457 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  34.09 
 
 
460 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0789  hypothetical protein  47.06 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3383  hypothetical protein  25.76 
 
 
456 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  19.54 
 
 
483 aa  44.7  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1517  hypothetical protein  33.05 
 
 
556 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.019243  normal  0.812738 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  34.07 
 
 
398 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  27.07 
 
 
495 aa  45.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  27.45 
 
 
476 aa  43.9  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  35.62 
 
 
585 aa  43.5  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  28 
 
 
497 aa  43.5  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>