195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3749 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  796    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  59.34 
 
 		 386 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  51.65 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  49.88 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  51.36 
 
 		 398 aa  336  5e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  28.16 
 
 		 362 aa  146  7.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  29.34 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  27.98 
 
 		 377 aa  136  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  28.32 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  28.39 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  28.39 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  28.25 
 
 		 378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  31.23 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  28.21 
 
 		 369 aa  126  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  31.17 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  30.66 
 
 		 365 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  30.08 
 
 		 390 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  30.49 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  28.61 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  28.09 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  30.25 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  29.58 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  28.73 
 
 		 387 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  27.84 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  27.98 
 
 		 362 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  29.08 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  35.45 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  28.33 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  28.57 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  30.42 
 
 		 436 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  30.42 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  30.42 
 
 		 436 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  30.42 
 
 		 436 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  30.42 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  30.42 
 
 		 436 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  35 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  30.42 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  27.16 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  31.4 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  28.33 
 
 		 390 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  27.44 
 
 		 382 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  27.44 
 
 		 382 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  30.77 
 
 		 387 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  34.84 
 
 		 363 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  27.8 
 
 		 390 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  28.95 
 
 		 367 aa  109  9.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  31.7 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  27.2 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  29.52 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  29.28 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  30.4 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  26.84 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  28.87 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  27.11 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  28.45 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  28.78 
 
 		 391 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  27.7 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  27.66 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  28.99 
 
 		 393 aa  106  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  27.9 
 
 		 416 aa  106  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  25.13 
 
 		 370 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  29.03 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  29.03 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  29.97 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  41.03 
 
 		 364 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  29.03 
 
 		 391 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  29.38 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  42.02 
 
 		 357 aa  100  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  28.29 
 
 		 391 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  29.22 
 
 		 385 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  28.68 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  28.5 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  29.71 
 
 		 390 aa  96.3  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  44.44 
 
 		 226 aa  95.1  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  28.43 
 
 		 424 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  28.57 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  38.79 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  29.06 
 
 		 390 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  29.06 
 
 		 390 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  22.55 
 
 		 384 aa  92.8  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  27.25 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  29.78 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  30 
 
 		 361 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  34.43 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  27.49 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  25.68 
 
 		 393 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  24.94 
 
 		 370 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  38.58 
 
 		 369 aa  86.7  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  27.47 
 
 		 409 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  27 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  26.55 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  39.1 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  44.35 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  29.06 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  26.8 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  27.03 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  28.69 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  27.23 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  27.53 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  26.67 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>