150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2755 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  760    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  50.92 
 
 
378 aa  378  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  48.91 
 
 
363 aa  346  4e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  48.65 
 
 
363 aa  346  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  49.47 
 
 
377 aa  346  5e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  47.55 
 
 
365 aa  339  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  46.32 
 
 
368 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  43.5 
 
 
370 aa  322  6e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  43.5 
 
 
370 aa  322  8e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  45.36 
 
 
378 aa  318  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  45.63 
 
 
373 aa  309  5e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  42.01 
 
 
416 aa  305  9.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  45.14 
 
 
364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  43.01 
 
 
357 aa  296  3e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  44.72 
 
 
378 aa  293  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  42.78 
 
 
367 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  42.78 
 
 
367 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  41.07 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  41.19 
 
 
362 aa  281  1e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  41.51 
 
 
364 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  39.84 
 
 
369 aa  258  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  39.84 
 
 
384 aa  236  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  39.36 
 
 
370 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  34.23 
 
 
376 aa  199  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.09 
 
 
382 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  23.92 
 
 
382 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  23.92 
 
 
382 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  28.72 
 
 
395 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  25.66 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  28.86 
 
 
398 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  35.64 
 
 
397 aa  104  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  25.78 
 
 
412 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  26.02 
 
 
365 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  23.48 
 
 
362 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  26.77 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  27.86 
 
 
390 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  27.86 
 
 
390 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  35.45 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  25.77 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  24.75 
 
 
392 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  26.26 
 
 
387 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  24.05 
 
 
388 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  27.82 
 
 
387 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  26.34 
 
 
386 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  27.32 
 
 
387 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  24.16 
 
 
393 aa  89.4  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  29.61 
 
 
226 aa  89  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  22.79 
 
 
409 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  25.21 
 
 
388 aa  89  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  24.38 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  26.24 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  25.12 
 
 
390 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  24.88 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  24.63 
 
 
390 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  25.44 
 
 
436 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  25.44 
 
 
392 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  25.44 
 
 
436 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  25.44 
 
 
436 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  25.44 
 
 
392 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  25.44 
 
 
392 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  25.44 
 
 
436 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  24.12 
 
 
390 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  25 
 
 
390 aa  87  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  24.73 
 
 
390 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  25.51 
 
 
424 aa  85.9  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  24.73 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  24.11 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  25.57 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  24.63 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  23.97 
 
 
410 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  24.8 
 
 
411 aa  84.3  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  25 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  27.86 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  23.89 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  26.59 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  24.88 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  24.37 
 
 
393 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  24.01 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  22.73 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  22.56 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  23.55 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  24.65 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  23.81 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  24.93 
 
 
386 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  22.51 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  21.94 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  21.68 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  24.04 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  28.42 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  22.74 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  38.46 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  22.43 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  22.7 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  42.11 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  22.34 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  22.64 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  28.11 
 
 
448 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  24.36 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  32.46 
 
 
391 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  23.87 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>