132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_1182 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  866    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  780    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  94.64 
 
 
392 aa  739    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  866    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  866    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  99.74 
 
 
392 aa  777    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  780    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  866    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  79.59 
 
 
392 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  82.14 
 
 
391 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  82.14 
 
 
391 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  81.38 
 
 
391 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  81.63 
 
 
391 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  81.89 
 
 
391 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  81.89 
 
 
391 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  75.84 
 
 
388 aa  557  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  74.37 
 
 
393 aa  532  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  69.92 
 
 
387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  69.67 
 
 
387 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  67.86 
 
 
390 aa  510  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  63.89 
 
 
395 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  62.53 
 
 
386 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  59.49 
 
 
390 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  58.72 
 
 
390 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  59.43 
 
 
390 aa  458  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  59.17 
 
 
390 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  58.91 
 
 
390 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  58.97 
 
 
390 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  58.72 
 
 
390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  58.21 
 
 
390 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  63.05 
 
 
386 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  57.61 
 
 
410 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  59.02 
 
 
388 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  56.63 
 
 
393 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  57.14 
 
 
395 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  61.7 
 
 
386 aa  432  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  56.89 
 
 
393 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  59.13 
 
 
385 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  62.05 
 
 
385 aa  418  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  57.89 
 
 
393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  60.46 
 
 
388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  57.62 
 
 
387 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  56.85 
 
 
387 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  56.59 
 
 
387 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  54.71 
 
 
390 aa  388  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  54.91 
 
 
392 aa  359  5e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  51.13 
 
 
388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  50 
 
 
390 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  50 
 
 
390 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  50 
 
 
390 aa  338  9e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  50.38 
 
 
388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  42.93 
 
 
365 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  42.49 
 
 
367 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  40.8 
 
 
362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  42.53 
 
 
361 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  39.63 
 
 
384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  37.31 
 
 
385 aa  210  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  39.69 
 
 
385 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  36.6 
 
 
410 aa  199  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  34.65 
 
 
382 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  25.37 
 
 
378 aa  111  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.25 
 
 
382 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  28.13 
 
 
386 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  29.08 
 
 
409 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  30.5 
 
 
394 aa  99.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  26.17 
 
 
395 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  24.87 
 
 
368 aa  97.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  25.44 
 
 
370 aa  97.1  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  24.37 
 
 
382 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  24.37 
 
 
382 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  25.69 
 
 
363 aa  89  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  25 
 
 
365 aa  88.2  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  26.98 
 
 
397 aa  87.4  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  24.43 
 
 
363 aa  87.4  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  31.37 
 
 
378 aa  86.3  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  23.81 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  29.58 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  27.32 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1049  hypothetical protein  73.68 
 
 
84 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  26.14 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  23.08 
 
 
364 aa  84  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  26.12 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  25.32 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  23.81 
 
 
373 aa  77  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  25.87 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  24.1 
 
 
370 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  23.8 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  24.38 
 
 
370 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  24.12 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  22.13 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  24.38 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  23.4 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  23.78 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  23 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  36.89 
 
 
362 aa  67  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  23.89 
 
 
395 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  22.89 
 
 
399 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  23.92 
 
 
393 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  24.46 
 
 
398 aa  64.3  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  27.15 
 
 
226 aa  63.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>