139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0229 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  781    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  80.83 
 
 		 386 aa  615  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  66.41 
 
 		 390 aa  532  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  66.07 
 
 		 390 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  65.89 
 
 		 390 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  65.63 
 
 		 390 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  65.81 
 
 		 390 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  65.55 
 
 		 390 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  65.63 
 
 		 390 aa  527  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  65.04 
 
 		 390 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  64.52 
 
 		 393 aa  522  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  64.71 
 
 		 395 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  64.68 
 
 		 388 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  64.01 
 
 		 410 aa  512  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  66.49 
 
 		 387 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  66.24 
 
 		 387 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  66.32 
 
 		 387 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  63.96 
 
 		 395 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  60 
 
 		 393 aa  486  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  64.42 
 
 		 386 aa  485  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  65.28 
 
 		 387 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  64.77 
 
 		 387 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  62.79 
 
 		 392 aa  461  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  58.61 
 
 		 390 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  62.53 
 
 		 436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  62.53 
 
 		 392 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  62.53 
 
 		 436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  62.53 
 
 		 436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  62.53 
 
 		 392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  62.53 
 
 		 392 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  62.53 
 
 		 436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  61.76 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  61.89 
 
 		 393 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  60.72 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  61.14 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  61.66 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  61.66 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  61.92 
 
 		 391 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  62.18 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  61.92 
 
 		 391 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  52.56 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  54.26 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  54.55 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  55.81 
 
 		 385 aa  378  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  55.13 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  49.49 
 
 		 388 aa  341  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  48.98 
 
 		 390 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  48.98 
 
 		 390 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  48.98 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  50.76 
 
 		 392 aa  322  8e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  47.96 
 
 		 388 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  41.6 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  42.29 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  41.97 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  40.87 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  37.97 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  39.23 
 
 		 385 aa  203  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  36.8 
 
 		 410 aa  203  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  36.87 
 
 		 385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  34.46 
 
 		 382 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  26.46 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.46 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  28.76 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  27.3 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  25 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  30.46 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  27.97 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  29.22 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  23.76 
 
 		 378 aa  96.3  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  29.12 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  24.02 
 
 		 378 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  27.2 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  26.34 
 
 		 370 aa  90.5  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  26.21 
 
 		 368 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  25.33 
 
 		 365 aa  87  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  24.94 
 
 		 409 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  22.4 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  22.83 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  25.21 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  28.08 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  25.85 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  22.78 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  25.76 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  25.13 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  25.13 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  25.99 
 
 		 364 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  25.07 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  24.19 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  24.18 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1049  hypothetical protein  68.52 
 
 		 84 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  25.81 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  23.33 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  25.38 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  22.02 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  21.89 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  22.14 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  25.45 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  23.28 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  23.01 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  23.71 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>