133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0490 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  864    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  60.49 
 
 
365 aa  501  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  54.77 
 
 
363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  55.01 
 
 
363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  44.85 
 
 
370 aa  350  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  44.58 
 
 
373 aa  348  1e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  44.36 
 
 
370 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  47.54 
 
 
364 aa  342  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  42.57 
 
 
357 aa  315  8e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  41.9 
 
 
378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  42.01 
 
 
370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  41.25 
 
 
378 aa  292  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  38.77 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  39.45 
 
 
364 aa  281  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  39.8 
 
 
362 aa  275  9e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  38.92 
 
 
368 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  38.31 
 
 
377 aa  261  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  35.32 
 
 
369 aa  258  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  35.66 
 
 
378 aa  243  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  46.45 
 
 
367 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  46.45 
 
 
367 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  35.94 
 
 
384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  35.27 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  32.21 
 
 
376 aa  186  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  27.27 
 
 
382 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  26.32 
 
 
382 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.32 
 
 
382 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  28.35 
 
 
395 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  27.44 
 
 
386 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  24.94 
 
 
412 aa  97.8  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  24.41 
 
 
397 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  24.86 
 
 
362 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  26.2 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  25 
 
 
390 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  24.02 
 
 
393 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  26.3 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  32.92 
 
 
394 aa  88.2  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  28.64 
 
 
398 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  24.07 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  23.98 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  24.59 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  29.95 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  26.51 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  25 
 
 
392 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  24.8 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  23.98 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  24.54 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  23.98 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  24.32 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  25.58 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  24.54 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  22.38 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  24.39 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  24.16 
 
 
388 aa  77  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  24.18 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  25.61 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  24.39 
 
 
361 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  23.95 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  25.92 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  23.28 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  24.64 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  24.94 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  24.13 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  23.27 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  25.57 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  23.98 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  25.32 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  25.42 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  25.42 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  23.27 
 
 
390 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  23.12 
 
 
390 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  25.32 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  25.33 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  25.32 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  25.32 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  21.45 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  26.2 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  25.32 
 
 
436 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  25.32 
 
 
436 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  25.32 
 
 
436 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  25.32 
 
 
436 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  22.77 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  25.77 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  24.75 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  24.18 
 
 
387 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  25.87 
 
 
393 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  29.95 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  23.81 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  23.98 
 
 
416 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  27.17 
 
 
448 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  24 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  26.39 
 
 
394 aa  65.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  23.15 
 
 
395 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  25 
 
 
397 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  23.15 
 
 
395 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  37.21 
 
 
388 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  22.96 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  23.04 
 
 
422 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  26.67 
 
 
448 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  25.62 
 
 
410 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>