129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2525 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  778    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  99.48 
 
 		 387 aa  775    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  93.8 
 
 		 387 aa  739    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  66.49 
 
 		 386 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  67.53 
 
 		 386 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  61.14 
 
 		 388 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  59.74 
 
 		 390 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  59.74 
 
 		 390 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  59.23 
 
 		 390 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  59.49 
 
 		 390 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  60.05 
 
 		 390 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  59.74 
 
 		 393 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  59.23 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  59.79 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  59.79 
 
 		 390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  60 
 
 		 395 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  59.23 
 
 		 410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  60.1 
 
 		 386 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  55.47 
 
 		 393 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  55.27 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  58.66 
 
 		 387 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  58.14 
 
 		 387 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  56.59 
 
 		 392 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  56.23 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  56.85 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  56.85 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  56.85 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  56.85 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  56.85 
 
 		 392 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  54.71 
 
 		 393 aa  378  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  56.85 
 
 		 392 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  56.85 
 
 		 392 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  55.56 
 
 		 388 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  57.62 
 
 		 391 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  56.38 
 
 		 393 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  55.81 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  57.36 
 
 		 391 aa  358  7e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  57.36 
 
 		 391 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  57.36 
 
 		 391 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  57.36 
 
 		 391 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  57.11 
 
 		 391 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  50.9 
 
 		 385 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  54.12 
 
 		 385 aa  341  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  49.62 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  51.93 
 
 		 388 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  49.23 
 
 		 390 aa  318  7e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  49.23 
 
 		 390 aa  318  7e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  49.23 
 
 		 390 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  44.74 
 
 		 362 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  46.13 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  50.13 
 
 		 392 aa  300  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  45.64 
 
 		 388 aa  286  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  44.27 
 
 		 365 aa  279  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  40.16 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  41.11 
 
 		 361 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  38.24 
 
 		 410 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  35.84 
 
 		 385 aa  202  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  35.58 
 
 		 384 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  38.62 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  34.82 
 
 		 382 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  28.25 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  28.16 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  28.61 
 
 		 395 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  26.98 
 
 		 377 aa  99.4  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  25.32 
 
 		 382 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.32 
 
 		 382 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  30.24 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  30.35 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  27.32 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  26.72 
 
 		 411 aa  89.7  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  27.55 
 
 		 368 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  23.3 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  27.3 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  31.34 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  26.63 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  26.47 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  23.73 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  24.65 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  23.1 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  24.66 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  21.24 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  24.66 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1049  hypothetical protein  61.4 
 
 		 84 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  25 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  27.57 
 
 		 226 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  23.76 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  25.33 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  23.17 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  22.08 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  24.59 
 
 		 364 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  22.76 
 
 		 365 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  24.74 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  24.06 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  22 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  22.11 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  25.27 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  21.59 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  22.95 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  22.82 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  22.99 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>