62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1049 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1049  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  64.63 
 
 
387 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  77.19 
 
 
393 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  63.41 
 
 
387 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  75.44 
 
 
392 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  73.68 
 
 
388 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  73.68 
 
 
391 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  73.68 
 
 
436 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  73.68 
 
 
436 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  73.68 
 
 
436 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  73.68 
 
 
436 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  73.68 
 
 
391 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  73.68 
 
 
391 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  73.68 
 
 
391 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  73.68 
 
 
391 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  73.68 
 
 
392 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  73.68 
 
 
391 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  73.68 
 
 
392 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  73.68 
 
 
392 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  61.43 
 
 
392 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  68.52 
 
 
386 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  64.91 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  68.52 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  59.65 
 
 
390 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  66.67 
 
 
390 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  59.65 
 
 
390 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  59.65 
 
 
390 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  61.4 
 
 
393 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  63.16 
 
 
387 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  59.65 
 
 
390 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  61.4 
 
 
395 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  59.65 
 
 
390 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  61.4 
 
 
390 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  59.65 
 
 
390 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  61.4 
 
 
387 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  61.4 
 
 
387 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  59.65 
 
 
410 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  56.67 
 
 
385 aa  72.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  63.16 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  63.16 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  64.91 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  63.16 
 
 
386 aa  72  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  57.89 
 
 
390 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  64.91 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  64.91 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  64.91 
 
 
388 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  59.65 
 
 
388 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  56.14 
 
 
393 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  57.89 
 
 
390 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  61.4 
 
 
388 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  59.65 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  57.63 
 
 
392 aa  63.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  43.06 
 
 
384 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  47.37 
 
 
365 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  47.46 
 
 
367 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  40.68 
 
 
410 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  40.98 
 
 
382 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  50 
 
 
361 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  34.38 
 
 
362 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  38.98 
 
 
385 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  38.98 
 
 
385 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  35.09 
 
 
409 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>