134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0197 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  100 
 
 		 367 aa  738    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  45.27 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  41.62 
 
 		 410 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  42.05 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  41.79 
 
 		 390 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  44.25 
 
 		 392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  41.54 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  41.27 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  41.54 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  41.12 
 
 		 390 aa  280  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  41.48 
 
 		 393 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  41.01 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  40.36 
 
 		 388 aa  275  8e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  42.09 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  40.92 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  42.49 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  42.49 
 
 		 392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  40.66 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  42.49 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  42.49 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  42.49 
 
 		 392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  42.49 
 
 		 392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  42.49 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  40.66 
 
 		 390 aa  269  5e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  45.1 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  40.76 
 
 		 395 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  41.97 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  42.03 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  41.75 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  41.13 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  41.13 
 
 		 387 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  40.97 
 
 		 385 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  42.24 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  40.16 
 
 		 387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  40.41 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  41.84 
 
 		 392 aa  252  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  40.67 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  39.64 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  43.04 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  44.78 
 
 		 391 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  41.84 
 
 		 388 aa  249  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  42.68 
 
 		 388 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  43.77 
 
 		 391 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  43.26 
 
 		 391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  43.3 
 
 		 391 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  43.3 
 
 		 391 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  39.69 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  39.69 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  38.16 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  43.3 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  42.78 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  39.69 
 
 		 390 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  40.41 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  38.35 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  38.8 
 
 		 361 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  36.05 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  34.96 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  35.79 
 
 		 410 aa  169  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  37.03 
 
 		 385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  35.86 
 
 		 382 aa  160  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  26.94 
 
 		 386 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  25.86 
 
 		 370 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  25.86 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  25.28 
 
 		 378 aa  90.9  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  24.38 
 
 		 382 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  24.38 
 
 		 382 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  23.56 
 
 		 382 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  27.3 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  23.84 
 
 		 378 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  28.95 
 
 		 394 aa  87  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  24.07 
 
 		 364 aa  86.3  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  24.66 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  22.29 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  25.22 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  25.72 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  25.07 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  25.69 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  23.88 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  23.66 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  25.82 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  24.39 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  23.81 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  24.79 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  24.2 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  24.8 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  21.91 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  24.16 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  24.19 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  22.95 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  24.57 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  24.57 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  38.1 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  26.82 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  24.73 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  24.7 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  23.04 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  22.7 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  23.01 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  23.98 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>