153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0636 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  100 
 
 
367 aa  758    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  100 
 
 
367 aa  758    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  49.73 
 
 
369 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  43.01 
 
 
370 aa  309  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  42.74 
 
 
370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  42.82 
 
 
363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  43.09 
 
 
363 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  43.86 
 
 
378 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  42.78 
 
 
370 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  40.65 
 
 
365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  38.96 
 
 
376 aa  282  6.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  43.05 
 
 
364 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  41.21 
 
 
377 aa  279  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  43.2 
 
 
384 aa  268  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  39.74 
 
 
378 aa  265  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  44 
 
 
370 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  39.3 
 
 
369 aa  262  8e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  39.89 
 
 
357 aa  261  1e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  42.25 
 
 
364 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  38.87 
 
 
362 aa  253  3e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  40.11 
 
 
373 aa  252  7e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  37.1 
 
 
368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  39.52 
 
 
378 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  46.45 
 
 
416 aa  216  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  30.1 
 
 
395 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  27.27 
 
 
382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  27.27 
 
 
382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.36 
 
 
382 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  26.97 
 
 
386 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  29.97 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  28.39 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  27.94 
 
 
394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  26.47 
 
 
409 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  23.21 
 
 
412 aa  98.6  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  24.78 
 
 
397 aa  96.3  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  25.89 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  24.23 
 
 
390 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  24.23 
 
 
390 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  32.93 
 
 
409 aa  90.1  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  25.36 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  24.12 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  25.14 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  23.41 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  24.23 
 
 
390 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  25.2 
 
 
422 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  25.48 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  29.95 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  23.12 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  23.86 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  23.54 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  24.06 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  25.57 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  25.13 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  23.54 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  22.78 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  23.16 
 
 
390 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  33.02 
 
 
226 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  23.62 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  22.9 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  23.16 
 
 
390 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  22.9 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  25.54 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  25.21 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  45.21 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  24.18 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  23.16 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  24.66 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  23.33 
 
 
450 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  25.46 
 
 
388 aa  72.8  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  24.33 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  22.67 
 
 
390 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  24.57 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  24.3 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  23.79 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  21.77 
 
 
395 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  21.55 
 
 
424 aa  66.2  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  25.28 
 
 
386 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  23.67 
 
 
584 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  21.77 
 
 
395 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  22.22 
 
 
384 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  29.35 
 
 
448 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  22.61 
 
 
359 aa  64.7  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  20.92 
 
 
411 aa  63.9  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  24.15 
 
 
410 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  21.78 
 
 
398 aa  63.2  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  30.41 
 
 
448 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  25.07 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  22.25 
 
 
397 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  23.91 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  26.19 
 
 
369 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  38.27 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  23.27 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  22.84 
 
 
365 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0931  hypothetical protein  30.56 
 
 
385 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  30.09 
 
 
392 aa  57  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  20.16 
 
 
394 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  34.18 
 
 
399 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  36.36 
 
 
385 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0144  putative RecF protein  37.88 
 
 
132 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  20.7 
 
 
393 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>