136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0146 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  100 
 
 
226 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  30.94 
 
 
364 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  41.03 
 
 
386 aa  99.8  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  33.17 
 
 
378 aa  99.4  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  30.24 
 
 
368 aa  96.3  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  30.3 
 
 
382 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  30.3 
 
 
382 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  40.17 
 
 
395 aa  95.5  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  29.8 
 
 
382 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  29.5 
 
 
378 aa  91.7  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  31.16 
 
 
377 aa  90.5  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  30.62 
 
 
363 aa  89.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  31.33 
 
 
378 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  29.61 
 
 
370 aa  89  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  30.66 
 
 
370 aa  88.6  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  30.14 
 
 
363 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  31.68 
 
 
362 aa  87  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  44.44 
 
 
394 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  30.19 
 
 
370 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  30.66 
 
 
364 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  30.52 
 
 
369 aa  85.1  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  35 
 
 
365 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  29.95 
 
 
416 aa  84.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  41.88 
 
 
398 aa  81.6  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  32 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  40.17 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  33.02 
 
 
367 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  33.02 
 
 
367 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  29.44 
 
 
387 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  33.77 
 
 
393 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  37.61 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  30.13 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  30.13 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  31.61 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  29.11 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  30.46 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  30.46 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  27.57 
 
 
387 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  27.57 
 
 
387 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  28.48 
 
 
390 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  29.49 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  26.24 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  27.85 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  27.85 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  31.03 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  30.26 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  27.85 
 
 
390 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  29.33 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  34.93 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  31.17 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  32.12 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  33.33 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  30.17 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  27.88 
 
 
410 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  28.95 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  25.68 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  30.57 
 
 
419 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  26.75 
 
 
385 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  28.3 
 
 
395 aa  64.3  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  30.53 
 
 
411 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  29.25 
 
 
386 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  30.14 
 
 
424 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  27.44 
 
 
388 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  28.95 
 
 
397 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  28.3 
 
 
362 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  31.93 
 
 
384 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  25.84 
 
 
390 aa  62.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  31.75 
 
 
385 aa  62  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  25.54 
 
 
388 aa  62  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  38.54 
 
 
399 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  27.4 
 
 
409 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  28.48 
 
 
365 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  31.78 
 
 
394 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  28.35 
 
 
392 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  25 
 
 
393 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  31.65 
 
 
393 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  35.29 
 
 
387 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  30.67 
 
 
386 aa  58.9  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  24.02 
 
 
388 aa  58.5  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  27.44 
 
 
412 aa  58.5  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  35.37 
 
 
385 aa  58.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  32.26 
 
 
410 aa  58.5  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  26.78 
 
 
395 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  27.15 
 
 
392 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  26.77 
 
 
391 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  30.77 
 
 
376 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  29.93 
 
 
399 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  27.15 
 
 
392 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  27.15 
 
 
392 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  25.98 
 
 
391 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  27.15 
 
 
436 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  25.98 
 
 
391 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  27.15 
 
 
436 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  27.15 
 
 
436 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  27.15 
 
 
436 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  25.98 
 
 
391 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  25.98 
 
 
391 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  25.98 
 
 
391 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  28.8 
 
 
398 aa  56.2  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  30.43 
 
 
380 aa  55.5  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>