31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1441 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1441  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  622  1e-177  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0532167  hitchhiker  0.00000885873 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1487  hypothetical protein  43.93 
 
 
343 aa  291  7e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  28.02 
 
 
513 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  22.6 
 
 
378 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  28.28 
 
 
464 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  23.5 
 
 
419 aa  50.4  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1940  hypothetical protein  26.19 
 
 
419 aa  49.7  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34914  hitchhiker  0.0000000111377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  34.72 
 
 
363 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  35.21 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0789  hypothetical protein  48.89 
 
 
396 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  28.57 
 
 
466 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  31.51 
 
 
540 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  31.25 
 
 
378 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  31.52 
 
 
457 aa  46.6  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  29.9 
 
 
465 aa  46.6  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  27.08 
 
 
429 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  28.38 
 
 
408 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  27.59 
 
 
457 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.33 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 
603 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  51.35 
 
 
591 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  47.06 
 
 
647 aa  43.9  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  45 
 
 
362 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.33 
 
 
372 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0003  RecF recombinational DNA repair ATPase  31.52 
 
 
353 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  43.18 
 
 
476 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  41.67 
 
 
623 aa  43.5  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0003  RecF recombinational DNA repair ATPase  31.52 
 
 
353 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  27.66 
 
 
459 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  24.14 
 
 
417 aa  42.7  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  29.89 
 
 
361 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>