51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1310 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  937    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  937    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  24.1 
 
 
476 aa  97.8  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2348  hypothetical protein  24.4 
 
 
461 aa  83.6  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  28.21 
 
 
513 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  33.62 
 
 
461 aa  72.4  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3383  hypothetical protein  28.92 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  33.33 
 
 
457 aa  64.7  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  41.18 
 
 
377 aa  57.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  23.08 
 
 
584 aa  56.6  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  28.7 
 
 
355 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  30.59 
 
 
459 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  33.87 
 
 
363 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  30.34 
 
 
391 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2713  hypothetical protein  22.53 
 
 
401 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173393  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  33.78 
 
 
478 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  36.36 
 
 
459 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  29.22 
 
 
441 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  33.33 
 
 
371 aa  50.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0326  ABC transporter related  25.66 
 
 
359 aa  49.7  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  decreased coverage  0.00902644 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1517  hypothetical protein  27.61 
 
 
556 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.019243  normal  0.812738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  26.6 
 
 
369 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  31.76 
 
 
497 aa  48.5  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0666  DNA replication and repair protein RecF  23.24 
 
 
333 aa  48.5  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0186794  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0471  hypothetical protein  26.71 
 
 
533 aa  47.8  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0692558  decreased coverage  0.00000000612882 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  30.91 
 
 
224 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  30.26 
 
 
451 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  30.91 
 
 
378 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  33.93 
 
 
374 aa  47.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  22.03 
 
 
429 aa  47.4  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  47.37 
 
 
564 aa  46.6  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0701  ABC transporter related  34.25 
 
 
254 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  37.25 
 
 
368 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  28.75 
 
 
467 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  34.09 
 
 
419 aa  45.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  20.25 
 
 
395 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  38.78 
 
 
416 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  27.85 
 
 
435 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  29.82 
 
 
323 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  30.77 
 
 
378 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  27.45 
 
 
374 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3360  hypothetical protein  26.39 
 
 
437 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0568  DNA replication and repair protein RecF  30.17 
 
 
340 aa  44.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  38 
 
 
527 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  29.33 
 
 
505 aa  44.3  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  28.1 
 
 
568 aa  44.3  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1940  hypothetical protein  32.95 
 
 
419 aa  43.9  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34914  hitchhiker  0.0000000111377 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  31.58 
 
 
339 aa  43.9  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  32.95 
 
 
461 aa  43.5  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2687  putative ATP-binding protein  27.92 
 
 
355 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.815306  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  39.68 
 
 
593 aa  43.1  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>