34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1872 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  100 
 
 		 585 aa  1197    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.67 
 
 		 548 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  28.61 
 
 		 566 aa  118  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0681  hypothetical protein  27.01 
 
 		 619 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0932  hypothetical protein  25.82 
 
 		 638 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05008  hypothetical protein  26.33 
 
 		 658 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  28.89 
 
 		 529 aa  72  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  28.57 
 
 		 584 aa  67.4  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  25.75 
 
 		 628 aa  55.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.36 
 
 		 616 aa  54.3  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  24.6 
 
 		 495 aa  53.5  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  28.15 
 
 		 666 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  25.48 
 
 		 691 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  22.47 
 
 		 398 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  27.24 
 
 		 623 aa  49.7  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  25.23 
 
 		 497 aa  48.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.66 
 
 		 652 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  27.72 
 
 		 650 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  24.56 
 
 		 385 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0578  hypothetical protein  28.02 
 
 		 660 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  38.36 
 
 		 457 aa  45.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  23.4 
 
 		 397 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  31.25 
 
 		 574 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1940  hypothetical protein  35.62 
 
 		 419 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34914  hitchhiker  0.0000000111377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  22.61 
 
 		 368 aa  45.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  25.26 
 
 		 564 aa  44.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  27.27 
 
 		 642 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  24.57 
 
 		 461 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.42 
 
 		 669 aa  44.3  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  28.17 
 
 		 448 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  34.62 
 
 		 435 aa  43.9  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  31.88 
 
 		 428 aa  43.9  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  31.18 
 
 		 450 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  29.35 
 
 		 448 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>