55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2027 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  891    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  42.99 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  42.4 
 
 		 451 aa  299  7e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  39.95 
 
 		 459 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  38.86 
 
 		 478 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  38.69 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  24.84 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  26.94 
 
 		 428 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  30.48 
 
 		 224 aa  99.8  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  24.24 
 
 		 465 aa  99.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  31.1 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  29.17 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  40.65 
 
 		 465 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  25.13 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  32.31 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  23.79 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  26 
 
 		 457 aa  91.3  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  31.2 
 
 		 527 aa  89.7  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  26.08 
 
 		 378 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  35.88 
 
 		 374 aa  86.7  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  29.55 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  33.61 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  26.15 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  32.24 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  34.65 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  31.93 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  26.32 
 
 		 508 aa  78.2  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  28.8 
 
 		 510 aa  72.8  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  26.02 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  27.27 
 
 		 617 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  34.07 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  29.29 
 
 		 514 aa  63.2  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  35.33 
 
 		 565 aa  60.1  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  29.09 
 
 		 483 aa  59.7  0.00000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  42.39 
 
 		 595 aa  57.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  38.03 
 
 		 457 aa  54.7  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  31.85 
 
 		 555 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  34.09 
 
 		 461 aa  53.5  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1481  hypothetical protein  38.55 
 
 		 140 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  25.62 
 
 		 513 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  29.63 
 
 		 584 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  29.73 
 
 		 564 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  34.31 
 
 		 349 aa  47.8  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  35.06 
 
 		 565 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1940  hypothetical protein  28.12 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34914  hitchhiker  0.0000000111377 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  29.21 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  27.85 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  27.85 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  21.63 
 
 		 386 aa  44.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  24.71 
 
 		 355 aa  43.9  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  34.62 
 
 		 585 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  29.27 
 
 		 442 aa  44.3  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  33.33 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  19.85 
 
 		 388 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2348  hypothetical protein  31.82 
 
 		 461 aa  43.1  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>