50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1481 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1481  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  286  9e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  92.75 
 
 		 349 aa  265  1e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  55.4 
 
 		 346 aa  160  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  29.91 
 
 		 353 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  38.55 
 
 		 435 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  37.31 
 
 		 428 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  26.02 
 
 		 378 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.43 
 
 		 548 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2549  SMC domain protein  32.06 
 
 		 315 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0441079  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  30.17 
 
 		 386 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  34.44 
 
 		 393 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  32.26 
 
 		 394 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  27.96 
 
 		 597 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  31.87 
 
 		 399 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  28.71 
 
 		 464 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  29.36 
 
 		 398 aa  44.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  29.41 
 
 		 382 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  29.76 
 
 		 527 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  28.45 
 
 		 362 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  37.31 
 
 		 595 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  31.08 
 
 		 465 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  30.43 
 
 		 386 aa  42.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  28.57 
 
 		 382 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2637  putative ATP-binding protein  32.61 
 
 		 353 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592528  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  34.85 
 
 		 226 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  31.68 
 
 		 408 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  28.4 
 
 		 276 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  28.45 
 
 		 394 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  45.83 
 
 		 758 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  24.81 
 
 		 358 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  35.23 
 
 		 397 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  37.7 
 
 		 355 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  31.58 
 
 		 412 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.39 
 
 		 634 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  32.77 
 
 		 365 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.62 
 
 		 708 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1472  ATPase-like protein  24.76 
 
 		 426 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0862565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  28.45 
 
 		 429 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  33.33 
 
 		 584 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  30.84 
 
 		 451 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  28.57 
 
 		 357 aa  41.2  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2592  hypothetical protein  27.36 
 
 		 429 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  35.62 
 
 		 367 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  35.71 
 
 		 380 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0618  hypothetical protein  32 
 
 		 578 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.508373  normal  0.13002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  28.57 
 
 		 566 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  47.83 
 
 		 529 aa  40.8  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  28.1 
 
 		 363 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  31.25 
 
 		 394 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  31.91 
 
 		 363 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>