22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1472 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1472  ATPase-like protein  100 
 
 		 426 aa  880    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0862565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0539  SMC domain-containing protein  51.67 
 
 		 391 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  26.61 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1945  hypothetical protein  22.82 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.710745  hitchhiker  0.000000000000362051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  50 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1106  hypothetical protein  24.4 
 
 		 372 aa  53.9  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0316487  hitchhiker  0.000249477 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  26.61 
 
 		 497 aa  50.8  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  52.83 
 
 		 564 aa  49.7  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1569  ATPase-like protein  33.73 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.768338  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  36.71 
 
 		 663 aa  47.4  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  27.59 
 
 		 349 aa  47.4  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  53.66 
 
 		 369 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  23.42 
 
 		 565 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1704  hypothetical protein  70.97 
 
 		 264 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.766621  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.82 
 
 		 548 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  34.43 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.59 
 
 		 615 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  43.9 
 
 		 358 aa  43.9  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0045  recombination protein F  34.41 
 
 		 372 aa  43.5  0.008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.498392  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  30.23 
 
 		 641 aa  43.1  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  30.88 
 
 		 390 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  30.88 
 
 		 390 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>