37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0900 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  99.48 
 
 
382 aa  775    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  100 
 
 
382 aa  780    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  46.13 
 
 
391 aa  322  8e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  28.11 
 
 
361 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  27.12 
 
 
381 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  27.32 
 
 
353 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  25.27 
 
 
396 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0488  ATPase-like protein  29.15 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  22.97 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1569  ATPase-like protein  22.29 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.768338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  32.03 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  32.32 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  46.97 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  36.59 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1141  ATPase-like protein  30.38 
 
 
366 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956923  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  36.59 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  28.28 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  49.06 
 
 
423 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  23.78 
 
 
564 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4619  hypothetical protein  34.65 
 
 
582 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.275765 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  40.91 
 
 
349 aa  47.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  26.47 
 
 
356 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0049  prophage Lp2 protein 4  25.4 
 
 
558 aa  47.8  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.19169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4244  hypothetical protein  48.78 
 
 
538 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777185  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1102  hypothetical protein  46.3 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.89522  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1457  putative ATPase  51.22 
 
 
347 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1225  DNA replication and repair protein RecF  35.38 
 
 
349 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.193168  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  36.73 
 
 
346 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  40 
 
 
497 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3830  hypothetical protein  48.78 
 
 
534 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531313  hitchhiker  0.000259973 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0002  DNA replication and repair protein RecF  40.85 
 
 
350 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.617644  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0003  DNA replication and repair protein RecF  40.85 
 
 
350 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00329262  decreased coverage  0.000397503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  47.92 
 
 
641 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  37.93 
 
 
339 aa  43.1  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  43.4 
 
 
565 aa  42.7  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1481  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  42.7  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  34.48 
 
 
340 aa  43.1  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>