63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2979 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  954    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  40.43 
 
 		 465 aa  354  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  41.14 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  37.5 
 
 		 465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  34.05 
 
 		 429 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  34.33 
 
 		 428 aa  213  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  31.75 
 
 		 408 aa  195  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  28.42 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  27.56 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  25.28 
 
 		 378 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  27.97 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  26.67 
 
 		 478 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  39.58 
 
 		 565 aa  100  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  27.87 
 
 		 457 aa  93.6  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  33.62 
 
 		 451 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  22.75 
 
 		 508 aa  88.6  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  28.7 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  32.05 
 
 		 555 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  34 
 
 		 510 aa  82  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  32.81 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 514 aa  80.1  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  34.38 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  36.17 
 
 		 595 aa  80.1  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  28.21 
 
 		 617 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  32.81 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  28.08 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  29.32 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  31.54 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  32.84 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  33.33 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  28.23 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  31.96 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  23.01 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  27.83 
 
 		 467 aa  57  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  26.47 
 
 		 391 aa  57  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  23.74 
 
 		 417 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  28.15 
 
 		 227 aa  54.7  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  28.02 
 
 		 461 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  61.36 
 
 		 454 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0135  hypothetical protein  34.04 
 
 		 96 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.203  normal  0.0435696 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  35.9 
 
 		 513 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  43.75 
 
 		 496 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1441  hypothetical protein  28.28 
 
 		 307 aa  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0532167  hitchhiker  0.00000885873 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  42.31 
 
 		 597 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  28.37 
 
 		 483 aa  48.1  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  37.68 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  33.8 
 
 		 486 aa  47.4  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  35.94 
 
 		 361 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  31.19 
 
 		 457 aa  47  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1487  hypothetical protein  30.25 
 
 		 343 aa  47  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  29.41 
 
 		 586 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  39.29 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  33.71 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1481  hypothetical protein  28.71 
 
 		 140 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  46.34 
 
 		 418 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  27.72 
 
 		 349 aa  44.7  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  27.16 
 
 		 346 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.48 
 
 		 652 aa  43.9  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  27.93 
 
 		 461 aa  43.9  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  31.94 
 
 		 572 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  41.54 
 
 		 393 aa  43.5  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  24.39 
 
 		 476 aa  43.5  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  40.35 
 
 		 450 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>